堿裂解法提取質粒的方法如下:
壹、實驗原理:
堿裂解法提取質粒是根據***價閉合環狀質粒DNA 與線性染色體DNA 在拓撲學上的差異來分離它們。在pH 值介於12.0 ~12.5 這個狹窄的範圍內,線性的DNA 雙螺旋結構解開而被變性,盡管在這樣的條件下,***價閉環質粒DNA 的氫鍵會被斷裂,但兩條互補鏈彼此相互盤繞,仍會緊密地結合在壹起。
當加入pH 4.8 的乙酸鉀高鹽緩沖液恢復pH 至中性時,***價閉合環狀的質粒DNA 的兩條互補鏈仍保持在壹起,因此復性迅速而準確,而線性的染色體DNA 的兩條互補鏈彼此已完全分開,復性就不會那麽迅速而準確,它們纏繞形成網狀結構,通過離心,染色體DNA與不穩定的大分子RNA ,蛋白質-SDS 復合物等壹起沈澱下來而被除去。
二、操作步驟:
1. 準備20ml滅菌過的培養管,編號,分別加入8ml LB培養基,再加入8?l 相應抗生素,可適量多加;
2. 用10?l 白色槍頭挑取挑取單個菌落至培養管中,37℃震蕩過夜(274rpm);
3. 取2ml過夜培養的菌液加入離心管中,室溫10000rpm離心2min,去上清;(可重復步驟2,直至菌液離心完)(去上清時用紙吸壹下)
4. 向留有菌體沈澱的離心管中加入250?l Buffer P1(含RNase A),使用移液槍充分混勻,懸浮菌體菌體;
5. 向離心管中加入250?l Buffer P2,溫和地上下顛倒混勻4~6次,獲得澄清的裂解液;(劇烈混合會使剪切染色體DNA,降低質粒純度)
6. 向離心管中加入350?l Buffer N3, 立即溫和地上下顛倒混勻4~6次,此時出現白色絮狀沈澱。室溫10000rpm離心15min;
7. 小心將步驟6中所得的上清液轉移至潔凈的吸收柱中。要保證沒有吸入沈澱和細胞碎片。室溫10000rpm離心1min,至裂解物完全通過吸收柱,倒掉收集管中的廢液;
8. 向吸附柱中加150?l Buffer PB,10000rpm離心1min,倒掉收集管中的廢液;
9. 向吸附柱中加400?l? Buffer PW(檢查是否加入無水乙醇),10000rpm離心1min,倒掉收集管中的廢液。再空離壹次,2min(此時可以加熱 Buffer EB,65~70℃);
10. 將吸附柱置於壹個新的離心管中,打開蓋子,吹風4min左右(確保乙醇被去除,乙醇會影響下面的步驟);
11. 向吸附柱的吸附膜中間部位加90?l Buffer EB(pET系列拷貝數低,加EB 70μl即可),室溫靜置2min。10000rpm離心1min;
12. 把液體倒回吸附柱,在10000rpm離心1min;
13. 混合質粒至壹個離心管中,做好標記,開蓋室溫放置兩小時左右。-40℃保存質粒。