全國人大常委會強調，為確保高鐵香港段運輸、經濟和社會效益，在西九龍站實施“壹地兩檢”，設立內地口岸區是必要的。特區政府與內地有關方面就“壹地兩檢”協商作出適當安排，是特區依法行使高度自治權的具體體現。在西九龍站設立內地口岸區，不改變特區行政區域範圍，不影響特區依法享有的高度自治權，不減損特區居民依法享有的權利和自由。
全國人大常委會指出，內地派駐機構依照內地法律履行職責，範圍嚴格限制在內地口岸區內，不同於基本法第18條規定的將全國性法律在整個香港特區實施的情況；西九龍站內地口岸區場地使用權的取得、期限和費用由特區政府與內地有關機構簽訂合同做出規定，符合基本法第7條關於特區土地所有權和使用管理的規定。實施“壹地兩檢”，符合基本法關於特區政府應當制定適當政策促進和協調各行業發展、提供適當的經濟和法律環境促進經濟發展等規定，符合“壹國兩制”方針和特區基本法的根本宗旨。
壹國兩制的方針是在為解決臺灣問題而提出的，但是在香港問題上最先使壹國兩制的方針得到貫徹執行。97回歸後，香港在壹國兩制方針的指導下，實行港人治港、高度自治的方針，保持了香港的高度的繁榮，同時為香港的發展提供了強大的後盾支持。