1、植酸酶
在花鱸飼料中添加中性植酸酶，提高了飼料中磷的利用率,減少磷排放量。飼料中植酸酶的添加可減少飼料中磷的添加量，降低飼料成本，提高飼料中磷的利用率，提高增重率。在牙鮃飼料中直接添加植酸酶，顯著提高了牙鮃的特定生長率、氮貯積率、磷貯積率,?降低了氮排放率和磷排放率,?但飼料效率和蛋白質效率沒有顯著變化，而添加用植酸酶預處理的豆粕，降低了植酸含量，提高牙鮃特定生長率、飼料效率、蛋白質效率和氮貯積率，顯著降低了氮、磷和鈣的排放量。此外，在尼羅羅非魚、異育銀鯽、青魚、斑點叉尾鮰、鯉魚等飼料中均有關於植酸酶的研究應用的報道。針對動物體消化系統的特異性，植酸酶有酸性植酸酶和中性植酸酶兩種。酸性植酸酶主要作用於畜禽類和有胃水產動物，而對於無胃或是消化道偏中性的水產動物則用中性植酸酶。所以針對不同的養殖對象采用相應的植酸酶。
2 、澱粉酶
澱粉酶的主要作用是促進澱粉的分解消化，與內源澱粉酶相互協同。飼料中添加澱粉酶後提高了腸道中澱粉酶的活性，澱粉酶活性的提高是外源酶和內源酶的疊加效應。在凡納濱對蝦飼料中添加每千克150毫克的澱粉酶，對增重率、特定生長率、餌料系數均無顯著影響。總體來看，單壹澱粉酶在水產飼料上的應用報道很少，通常是作為復合酶制劑的壹種成分而應用
3、 脂肪酶
在飼料中增加脂肪的含量，會產生對蛋白質的節約效應，提高蛋白質效率，促進動物生長。脂肪酶功能是將脂肪水解為甘油壹酯、甘油二酯和遊離脂肪酸，是動物體內的壹種重要消化酶。目前對脂肪酶的研究還不多，因其多樣性和穩定性較差、底物不溶於水、生產成本較高等原因，有關脂肪酶在水產飼料中的研究很少。谷金皇等在瓦氏黃顙魚飼料中添加每千克300毫克 的脂肪酶，提高了魚體增重率?百分之9.29，降低了飼料系數百分之六點三五。在南方鮎魚飼料中添加每千克100毫克和每千克300毫克脂肪酶，增重率也提高了百分之4.0和百分之5.8，飼料系數降低了百分之5.0和百分之6.6；同時增加了粗脂肪的消化率和蛋白質效率。