成蟾晝伏夜出，成蟾以昆蟲為為食。白天多隱藏在石下、腐爛植物堆或土穴中，繁殖季節進入水域。雄性峨眉髭蟾會在水下爭鬥，如用頭頂對方的腹部、用角質刺攻擊對方。雄蟾有照顧受精卵的習性，壹旦後代孵化雄蟾就會返回森林。雄蟾有築巢護卵習性，選擇水流平緩、砂底且有較大石塊的地方築巢。
峨眉髭蟾蝌蚪以植物碎屑和水生昆蟲為食。峨眉髭蟾蝌蚪生活的環境相對海拔都較高，生活水域水質清新、食物來源相對較少，對蝌蚪消化道的解剖發現其主要食物為植物碎屑和水生昆蟲，且消化道內有大量的泥沙，越靠近肛門泥沙含量越高。峨眉髭蟾蝌蚪所食用的食物營養價值相對較低，其較長的消化道有利於提高食物的消化吸收率。峨眉髭蟾蝌蚪生活的水環境水溫常年維持在25 攝氏度以下，導致其代謝率也偏低。