青蒿藥用價值很高，夏末秋初拔出洗凈曬幹供藥用。清虛熱用莖葉、熬膏用子與根。青蒿素來源於傳統中藥青蒿草，已有2000年的歷史。由於它起效快並且沒有其它抗瘧藥那樣的副作用，因此抗瘧效果非常顯著。此外，到目前為止還沒有已知的青蒿素抗藥性的病例。而復方又可以更進壹步減少抗藥性產生的機會，並提高療效。
青蒿水煎液對表皮葡萄球菌、卡他球菌、炭疽桿菌、白喉桿菌有較強的抑菌作用，對金黃色葡萄球菌、綠膿桿菌、痢疾桿菌、結核稈菌等也有壹定的抑制作用。青蒿揮發油在0.25%濃度時，對所有皮膚癬菌有抑菌作用，在1%濃度時，對所有皮膚癬菌有殺菌作用。
青蒿素有抗流感病毒的作用。青蒿酯鈉對金葡萄、福氏痢疾桿菌、大腸桿菌、卡他球菌，甲型和乙型副傷寒稈菌均有壹定的抗菌作用。青蒿中的谷甾醇和豆甾醇亦有抗病毒作用。