目前組織芯片在癌癥方面的研究的高通量、節省試劑、高效率等優勢得到廣泛認可，壹般的研究單位欲開展組織芯片技術必然需要選擇壹款工具，從三點簡要說明選購組織芯片儀：
壹、首先，認識組織芯片儀的定義
劃分手動和自動主要在於工具使用核心-取樣的過程是否自動化。
1、手動工具很簡單-鉆取樣本通過手完成。
2、半自動工具-半自動工具可以同時容納多個臘塊，轉換臘塊使用自動轉動底盤，但最後取樣還是使用手來成。?
3、全自動（AUTO)-從樣本興趣點的識別、取樣、轉移至受體臘塊、點樣、信息的記錄完全使用軟體自動控制。僅需把相關參數輸入至軟體，按開始即可。
二、其次，選擇品牌是進口還是國產
1、國產
國產的工具比較的簡單，目前儀器提供的鉆頭尺寸較少，通常是0.6mm/1mm/1.5mm為多。
2、進口
進口儀器造工優美、大方，儀器設計精巧，使用起來比較的順手。自組織芯片技術發表文章之後，商業化的工具隨後就制造出來了，最早的如美國Beecher，早期的結構比較的簡單，鉆頭2對壹組，分別用於挖取組織和制作受體空白臘塊。鉆頭的規格從0.6mm、1mm到1.5mm和3mm，後期，諸多商家競相模仿，比如韓國UNITMA-Quick-ray、美國PG(本是生產Beecher，後來跳出自己另設品牌）等。
三、最後，是手動還是自動
目前市面超過2/3的工具為手動，不完全統計，在2002-2006，組織芯片有關的文章甚多，國內多數三甲單位都有采購組織芯片儀。其次有壹家是半自動，全自動有2-3家，美國Beecher，韓國UATM-272，匈牙利3D等。