中國藥科大學中藥標本館坐落在南京燕子磯腳下的中國藥科大學校園內。這裏的建築皆依山而造，布局錯落有致，頗有中國園林建築的獨特風格。校園內花木扶疏，藥圃蔥郁，綠草如茵，壹派迷人的南國風情。
中國藥科大學是我國最早獨立設制的藥學高等學府，原為1936年始建的國立藥學專科學校。1986年10月，學校改稱現名後，隨之在原藥用植物標本室和原生藥標本室的基礎上，正式建立中國藥科大學中藥標本館。
中藥標本館由生藥標本室、藥用植物標本室和綜合展示室三個部分組成。生藥標本室內，存放著經幾代學者多年收集、鑒定的生藥標本。其中既有野山參、鹿茸、犀牛角、虎骨、牛黃、馬寶、猴棗、羚羊角、麝香等名貴藥材，也有數千種不同產地、不同時間的常用中藥材；市場出現的多種假冒藥材，這裏也有專櫃存放，為中草藥鑒定、辨偽提供實物材料。另外，中國藥科大學獲國家科技進步壹等獎的攻關項目《常用中藥材品種整理與質量研究》所涉及20多個專題的藥材標本，也完整地保留在生藥標本室，有著很高的研究收藏價值。
寬敞明亮的綜合展示廳，陳列著本世紀三、四十年代德國E.Merck公司制作的國外生藥標本300余瓶。長沙馬王堆壹號漢墓考古出土的部分藥材也在這裏展出，數量雖不多，但是館內藏品中歷史最長的藥材標本。此外，常用中藥材粉末鑒定標本、常用中草藥飲片標本、香港有毒藥材標本、名貴中成藥樣品、常用礦物、動物藥材標本等也濟濟壹堂。綜合展示廳內的展品，從礦物、植物到動物，從地下部分到地上部分，從整體到局部，從飲片至成藥，無不使您感受到我國中醫藥文化淵源流長、博大精深。
藥用植物標本室內有6000多種臘葉標本，按恩格勒分類系統有序的排列在標本櫃中。在眾多的展品中，有1880年美國采集制做的臘葉標本，本世紀初前蘇聯采集制作的臘葉標本、同越南、朝鮮、日本等國交換的臘葉標本、建校初期采自峨嵋山的數千份藥用植物標本以及采自黑龍江大興安嶺、內蒙古、西藏、新疆、西雙版納、海南等邊遠地區的珍貴藥用植物標本。
在中藥標本館旁，還有始建於1958年的藥用植物園和栽培溫室。植物園占地40畝，栽培著藥用、觀賞植物1000多種。濃密的樹蔭下，幽靜的小道旁栽滿了各種名稱、各種功用的中草藥。這裏有高大的木本、纏綿的藤本、羞澀的蕨類、低矮的灌木、形態各異的草本等。造型別致、四季如春的大型溫室，栽培著多種熱帶藥用植物和珍稀觀賞花卉，有很高的研究和觀賞價值。
作為中國藥科大學重要的科教基地，同時也作為“全國高等學校博物館學會”和“全國中醫藥院校標本館專業委員會”的常務理事單位，中藥標本館不僅在中草藥鑒定、中藥泡制、植物資源利用、中藥標本館建設等方面進行了深入而廣泛的研究，還同美國、英國、日本、意大利、加拿大、瑞典等30多個國家和地區開展了廣泛的科研交流與合作，博得了國內外同行的壹致好評。
中醫藥文化是中華民族的國粹，是古代勞動人民利用天然藥材同疾病鬥爭的智慧結晶，有著幾千年的發展史。隨著社會的科技進步，對利用天然藥物也愈加重視。中草藥療效確切，毒副作用小，再加上中醫藥獨特的養生保健內涵，這使得中藥標本館每年都吸引了大批國內外學者、大中小學生、旅遊者前來參觀學習，以了解歷史悠久的中醫藥文化和養生保健之道。1997年該館被南京市教委定為中小學科普教育基地。