壹、植物分類概念的不同：園林植物分類學是以園林建設為宗旨，對園林植物的分類習性、繁殖、栽培管理和應用等方面進行系統研究的壹門學科。植物分類學是壹門主要研究整個植物界的不同類群的起源，親緣關系，以及進化發展規律的壹門基礎學科。也就是把紛繁復雜的植物界分門別類壹直鑒別到種，並按系統排列起來，以便於人們認識和利用植物。
二、植物分類宗旨不同：園林植物分類學研究的宗旨是為了更好地進行園林建設為；植物分類學研究的宗旨是為了是為了讓人們認識植物和利用植物。
三、植物分類的方法不同：園林植物分類的方法是按植物的習性、繁殖、栽培管理和應用等進行系統分類研究的；植物分類的方法是按植物的起源，親緣關系，以及進化發展規律進行系統分類研究的。
四、植物分類的目的不同：園林植物分類的目的，是通過植物分類使園林植物與園林規劃設計理論，生物學、觀賞園藝和園林學的基本理論、基本知識和基本技能，在城市生態、園林景觀、城鄉環境的綠化美化上得到科學應用。植物分類的目的，是通過植物分類用分類成果，指導人們對植物細胞學、植物學、生物學、林學、生態學等理論進行系統研究，為人們認識植物和保護植物，為植物繁衍、生長提供科學依據。
五、植物分類的對象相同：園林植物分類和植物分類的對象是相通的，它們分類的對象都是指物。