分子量的大小是根據所用質譜檢測的Z大M/Z來決定的，可能做到1000到2000，但是如果產生的是分子離子，就是帶多電荷，那M/Z就會小些。
質譜技術是壹種鑒定技術，在有機分子的鑒定方面發揮非常重要的作用。它能快速而極為準確地測定生物大分子的分子量。