截至2014年7月，學校有1個國家工程研究中心，1個國家級科技合作基地，7個省級工程技術研究中心，18個省部級重點實驗室。 獨立機構：大連海事大學國際海事公約研究中心、航運發展研究院、航海訓練與研究中心、航海教育研究所 國家級重點實驗室：海灣生態國際科技合作基地、船舶導航系統國家工程研究中心 省部級重點實驗室：
遼寧省船舶安全與汙染控制工程技術研究中心、遼寧省船用集成電路片上系統SOC設計工程技術研究中心、遼寧省船舶節能環保工程技術研究中心、遼寧省公路工程重點實驗室、遼寧省交通與重大裝備物聯網工程技術研究中心、遼寧省輪機監控與仿真工程技術研究中心、遼寧省船用小型燃氣輪機技術重點實驗室、遼寧沿海開放與經濟發展研究基地、遼寧省馬克思主義中國化研究中心、遼寧省船舶機電壹體化重點實驗室、大學英語教學研究基地、遼寧省船舶汙染監測與檢測的信息化技術重點實驗室、輪機科學與運用工程遼寧省高校重點實驗室、港航機電控制工程遼寧省高校重點實驗室、遼寧省船舶自動化工程重點實驗室、遼寧省船舶裝備維修工程技術研究中心、遼寧省環境系統生物學重點實驗室、遼寧省國際海事法律研究中心、遼寧省物流航運管理系統工程重點實驗室、遼寧省交通安全與通信技術重點實驗室、交通裝備先進制造與控制技術遼寧省高校重點實驗室、交通信息工程遼寧省高校重點實驗室、遼寧省高氣壓強電場電離放電重點實驗室 、強電離放電單分子工程遼寧省高校重點實驗室、船機修造工程交通運輸行業重點實驗室、遼寧省船機修造工程重點實驗室、航海動態仿真與控制交通運輸行業重點實驗室、遼寧省鍍鐵工程技術研究中心 截至2013年，海大圖書館有館藏文獻209.05萬收藏單位，其中中文圖書172.44萬冊、外文圖書22.23萬冊、期刊合訂本10.38萬冊、縮微資料4萬余件；年訂購報刊1017種（其中中文報刊820種，外文報刊197種）。
學術期刊
《大連海事大學理科學報》、《大連海事大學文科學報》、《航海教育研究》、《世界海運》。