顏色不同：林麝脖子兩邊有白色長條狀條紋，幼年背部有斑點。馬麝眼睛周圍有黃色的毛，背部有黑斑。原麝全身多為黑色。
分布地區不同：林麝主要分布在東北地區。馬麝主要分布在青藏高原等地。原麝主要分布在小興安嶺地區。