1、產生形式不同：
外毒素指的是在細菌在生活過程中菌體內產生並分泌到菌體外的毒素，大多為蛋白質，易提取，不耐熱。
內毒素指的是某些革蘭氏陰性菌在生活過程中產生，以脂多糖的形式存在於細胞壁上，菌體裂解後釋放，不易提取，耐熱。
2、毒性作用不同：
外毒素強，對組織器官有選擇性毒害效應，引起特殊臨床表現
內毒素較弱，各菌的毒性效應大致相同，引起發熱、白細胞增多、微循環障礙、休克、DIC醫`學教育網搜集整理等
/iknow-pic.cdn.bcebos.com/a50f4bfbfbedab64ea3f84adf836afc379311e0a"target="_blank"title=""class="ikqb_img_alink">/iknow-pic.cdn.bcebos.com/a50f4bfbfbedab64ea3f84adf836afc379311e0a?x-bce-process=image%2Fresize%2Cm_lfit%2Cw_600%2Ch_800%2Climit_1%2Fquality%2Cq_85%2Fformat%2Cf_auto"esrc="/a50f4bfbfbedab64ea3f84adf836afc379311e0a"/>
3、抗原性不同：
外毒素強，刺激機體產生抗毒素；甲醛液處理脫毒形成類毒素；
內毒素弱，刺激機體產生的中和抗體作用弱；甲醛液處理不形成類毒素。
/baike.baidu.com/item/%E7%BB%86%E8%8F%8C%E6%AF%92%E7%B4%A0/3763514?fr=aladdin"target="_blank"title="百度百科——細菌毒素">百度百科——細菌毒素