1、作用不同：明目地黃丸滋腎，養肝，明目，用於肝腎陰虛。六味地黃丸為補益劑，具有滋陰補腎之功效。
2、性狀不同：六味地黃丸為棕褐色至黑褐色的大蜜丸，味甜而酸。明目地黃丸為深棕色的濃縮丸，氣微香，味先甜而後苦，澀。
3、成分不同：明目地黃丸的成分有熟地黃，山茱萸（制），牡丹皮，山藥，茯苓，澤瀉，枸杞子，菊花，當歸，白芍，蒺藜，石決明（煆）。六味地黃丸成分為熟地黃，酒萸肉，牡丹皮，山藥，茯苓，澤瀉。
擴展資料：
註意事項：
1、忌煙，酒，辛辣刺激性食物。
2、感冒時不宜服用。有高血壓，心臟病，肝病，糖尿病，腎病等慢性病嚴重者應在指導下服用。
3、兒童，孕婦，哺乳期婦女，年老體弱，脾虛便溏者應在指導下服用。
4、平時有頭痛，眼脹，虹視或青光眼等癥狀的用戶應去醫院就診。
5、眼部如有炎癥或眼底病者應去就診。
百度百科-六味地黃丸
百度百科-明目地黃丸