首先應針對病因進行處理，停用可疑藥物和食物，積極治療全身性疾病，糾正口腔酸性環境等。
局部治療：可用軟毛牙刷蘸消毒劑輕輕刷洗舌毛區。毛舌絲過長、有惡心癥狀者，可到專科門診由醫生手術，修剪過度伸長的絲狀乳頭。也可用制黴素含片1片(50萬單位)含服，每日三次。局部用藥可塗擦4%的尿素溶液，經數分鐘輕刷後沖洗，此法有壹定的療效。含漱可用2%蘇打水，每日多次，可抑制黴菌的生長，以利黑毛消退。局部可塗激素軟膏(強的松、氟美松等)每日三次。還可使用1：200黃連素液或1：1000核黃素液，局部塗擦，每日三次。近年有報道，使用1%足葉草脂(鬼血樹脂)的丙酮-乙酸溶液，局部塗擦然後迅速沖洗，以防藥物下咽，每日三次，可迅速見效。