Engineered bacteriophages for treatment of a patient with a disseminated drug-resistant Mycobacterium abscessus. Nature Medicine . 2019 May;25(5):730-733. doi: 10.1038/s41591-019-0437-z. Epub 2019 May 8.
濫用抗生素導致耐藥細菌誕生，有好多超級細菌，目前所有高級抗生素不能治療。除了研制更高級抗生素之外，是不是還有其他方法呢？ mycobacteria：分子桿菌屬 就是壹種比較難以治療的菌種，結核分枝桿菌就是其中的壹種。已經出現耐藥的結核分子桿菌（mycobacterium tuberculosis）和非結核性分枝桿菌（non-tuberculsis mycobacteria）。患有先天性肺囊纖維化（cystic fibrosis）的患者，最容易感染 NTM 。
患有先天性肺囊纖維化的患者，最終都需要進行肺移植。但是肺移植之前合並的NTM感染，往往導致移植的推遲或移植後的不良後果。由於免疫抑制劑的使用，移植後發生的普通感染就很難控制，如果合並耐藥細菌，治療將是難上加難。
噬菌體是病毒的壹種，靠寄生細菌而存活和傳宗接代。其中Ecoli大腸桿菌是最容易被噬菌體感染的細菌，實驗中經常利用Ecoli大腸桿菌培養和擴增病毒，通過電轉染（electrophoresis）或熱休克（hot shock）的方法很容易將各種病毒質粒轉入Ecoli，之後各種質粒翻譯轉錄，組裝成病毒，破壞Ecoli菌體而出。然後利用擴增後的慢病毒lentivirus進行基因幹預。
既然噬菌體可以侵蝕細菌，能否利用噬菌體治療體內的細菌感染，尤其是難治性、耐藥的細菌呢？
15歲女性，因為先天性肺囊性纖維化，導致肺功能進行性衰竭，擬行肺移植，但是術前合並有如下細菌感染：Pseudomonas
aeruginosa（銅綠假單胞菌）和 M. massiliense導致的膿腫。肺移植前針對上述感染，口服或靜脈抗生素 連續8年 。盡管治療囊性纖維化的藥物lumacaftor/ivacaftor持續使用，但是肺功能進行性下降，FEV1 下降至0.63。最終進行了雙側肺移植，術後免疫抑制的情況下，積極給與靜脈和口服抗生素，由於出現惡心、厭食、腹瀉及水電解質失衡等副作用，不得不暫停靜脈抗生素。
停用抗生素後，即發現手術切口紅腫，雙肺實變，痰培養發現膿腫性分枝桿菌感染，提示分子桿菌感染。 給與Clofazimine（氯苯吩嗪）和 bedaquiline兩種強效治療分子桿菌的藥物，並且繼續之前停用的靜脈藥物。
因為同時出現腹痛、肝臟腫大、肝功能異常以及EBV血癥，完善PET-CT：胸骨破壞、肝門周圍腫大淋巴結。
首先需要分離培養感染的分枝桿菌，移植後壹月，終於形成菌落colony，命名為GD01。之後選取分枝桿菌分離的噬菌體，進行***培養，驗證其對 massiliense的殺菌活性，壹***驗證的大約 10000 種噬菌體。找到壹種 muddy的噬菌體可以有效感染GD01菌株 ，另壹種Zoej噬菌體也可以感染GD01，盡管EOP稍低。通過 bacteriophage recombineering of electroporated DNA 技術改造Zoej噬菌體的抑制基因，大大增強期感染GD01的效率。還有壹個BPs噬菌體，擁有單堿基突變的mutant（HRM1和HRM10），具有更高的感染效率。
另外又選取其他類似病患，分別為GD02、GD03、GD04，篩選可以感染殺滅菌株的噬菌體，發現muddy、zoej 和Bps三種噬菌體並不是對所有的GD都敏感。持續對GD01菌株，使用三個噬菌體連用的cockail療法，發現可以殺滅大部分分枝桿菌。
首先將三聯cocktail噬菌體胸部切口局部用藥，未發現過敏等不良反應。後改為靜脈輸註噬菌體治療，q12h，連續32 weeks。頭兩天出現出汗、皮膚發紅，但是沒有發熱及其他體征。
噬菌體測定單位：PFU/ml，plaque forming unit per ml。