1、花朵不同：黃堇的花朵比小花黃堇略大，而且花瓣也較寬，花形顯得比較飽滿，而小花黃堇的花朵相對較小，花瓣也較窄，花形較為細長。
2、花莖不同：黃堇的花莖比小花黃堇略高，通常超過30厘米，而小花黃堇的花莖則較矮小，不超過25厘米。