首先，碳纖維和石墨纖維的碳原子排列方式不同。碳纖維的碳原子是以四面體的方式排列，而石墨纖維的碳原子則是以六角形網格的方式排列。這種不同的排列方式導致了兩種纖維在物理性質上存在差異，例如碳纖維具有較高的強度和硬度，而石墨纖維則相對較柔軟。
其次，碳纖維和石墨纖維的物理性質也有很大差異。碳纖維具有較高的電導率和熱導率，密度較低，具有較好的輕量化和電磁屏蔽性能。而石墨纖維則相對密度較高，具有較好的導電性和熱傳導性能，適合應用於電磁屏蔽和熱傳導應用中。
最後，兩種纖維在應用上也有所不同。碳纖維主要用於航空航天、汽車和體育用品等領域，以及高端商務和個性化的定制纖維。而石墨纖維則主要用於高端商務、家居和電子等領域，以及具有導電性和熱傳導性能要求的應用中。
總結起來，碳纖維和石墨纖維具有不同的物理性質和應用領域，選擇哪種纖維取決於具體需要和應用要求。