聲優：竹內順子
角色介紹：本作的主人公，從大木博士那裏得到了小火龍，被大木博士委托後開始了完成神奇寶貝圖鑒的冒險。 聲優；江口拓也
角色介紹：大木博士的孫子，小紅的竹馬之交，和小赤同樣受到大木博士的完成神奇寶貝圖鑒的委托。 聲優：杉田智和
角色介紹：尼比市的道館訓練家，人稱“堅硬巖石般的男人”。 聲優：森功至
角色介紹：神奇寶貝研究的權威，將神奇寶貝圖鑒和最初的神奇寶貝交給小赤和小綠的人。 聲優：雪野五月
小赤的母親。 聲優：小山力也
角色介紹：火箭隊現任首領、常磐市道館的前任館主，部下統稱他為“阪木老大”。另外旗下還經營有很多的公司、遊樂場等等。 主條目：富士博士
聲優：稻葉實
角色介紹：是壹個住在關東地區紫苑鎮的溫柔的和藹老人，在紫苑鎮將自己的屋子改造成神奇寶貝小屋，照顧壹些被遺棄或是失去父母的年幼的神奇寶貝，得知火箭隊的成員在神奇寶貝塔殺害了嘎拉嘎拉後，富士老人沖進他們的藏身處怒斥火箭隊傷害神奇寶貝的行為。火箭隊將富士老人挾持為人質，直到小赤趕走了這些入侵者富士老人才得救。為了感謝主人公，富士老人送給主人公神奇寶貝之笛和Mega進化之石。過去曾住在紅蓮島上，是神奇寶貝研究所的創始人，年輕時曾是神奇寶貝博士（富士博士）。 聲優：石川由依
角色介紹：是在神奇寶貝小屋幫忙照顧神奇寶貝的壹個誌願者。