基因表達譜數據標準化方法不包括:最小加權法標準化。
基因表達譜(gene expression profile):指構建處於某壹特定狀態下的細胞或組織的非偏性cDNA文庫,通過大規模的cDNA測序,收集cDNA序列片段、定性、定量分析其mRNA群體組成,從而描繪該特定細胞或組織在特定狀態下的基因表達種類和豐度信息,這樣編制成的數據表就稱為基因表達譜。
基於微陣列技術,即使壹些組織沒有顯著變化,利用基因表達譜也能夠對之做出早期診斷;基於基因表達譜的腫瘤分型和分類研究為理解腫瘤的發生的機制,以及腫瘤的臨床治療提供了重要依據;研究人員可以根據基因表達譜的變化來區分形態學上相似的腫瘤,而腫瘤類型的精確診斷將有助於制定配套的最佳治療方案。
基因表達譜的獲得與表示:在基因芯片的實驗中,首先選取來自不同狀態的樣本,如正常組織與腫瘤組織、不同發育階段組織,或用藥前後的細胞或組織等。其中壹種被稱為實驗樣本,另壹種就是相應地被稱為參考樣本。
實驗樣本和參考樣本mRNA在逆轉錄過程中,分別用不同的紅、綠熒光基團標記,並將它們混合,與微陣列上的探針序列進行雜交,經過適當的洗脫步驟後,用激光掃描儀對芯片進行掃描,獲得對應於每種熒光的熒光強度圖像,通過專用的圖像分析軟件,可獲得微陣列上每個點的紅、綠熒光強度,其比值稱為該基因在實驗樣本中的表達水平。