1、抗菌類藥物
(1)抗生素類：常用的有土黴素、青黴素、強力黴素、金黴素、甲碸黴素、氟苯尼考等。
(2)磺胺類：有磺胺嘧啶、磺胺甲基嘧啶、磺胺間甲氧嘧啶、甲氧芐氨嘧啶等。磺胺類藥物在鰻魚飼料添加劑中已禁止使用。
(3)喹諾酮類：有氟哌酸(諾氟沙星)、氟嗪酸(氧氟沙星)、吡哌酸、惡喹酸、萘啶酸等。此類藥物抗菌效果普遍較好，具有抗菌範圍廣、殺菌能力強等優點，是防治水產動物細菌病的有效藥物。
在抗菌類藥物中，抗生素類中的紅黴素、氯黴素、泰樂菌素、桿菌肽鋅已被禁止用於魚病防治及作為飼料藥物添加劑。磺胺類中的磺胺噻唑(消治龍)、磺胺咪(磺胺呱)被禁用。喹諾酮類中的環丙沙星已被禁用，恩諾沙星藥殘已作為限制鰻魚出口日本的壹主要因子。另壹類抗菌藥物硝基呋喃類中的呋喃唑酮(商品名為痢特靈)、呋喃西林(又名呋喃新)、呋喃它酮、呋喃那斯也已被禁用。養殖戶在生產過程中可用其它抗菌藥物代替。