1 龜鱉目 Testudines
1.1 曲頸龜亞目 Cryptodira
1.2 側頸龜亞目 Pleurodira
2 喙頭蜥目 Sphenodontia
3 有鱗目 Squamata
3.1 蜥蜴亞目 Lacertilia
3.1.1 鬣蜥下目 Iguania
3.1.2 壁虎下目 Gekkota
3.1.3 石龍子下目 Scincomorpha
3.1.4 復舌下目 Diploglossa（又譯蛇蜥下目）
3.1.5 厚背下目 Platynota（又譯巨蜥下目）
3.2 蛇亞目 Serpentes
3.2.1 真蛇下目 Alethinophidia
3.2.2 盲蛇下目 Scolecophidia
3.3 蚓蜥亞目 Amphisbaenia
4 鱷目 Crocodilia
[編輯] 龜鱉目 Testudines
[編輯] 曲頸龜亞目 Cryptodira
鱷龜科 Chelydridae
海龜超科 Chelonioidae
海龜科 Cheloniidae
棱皮龜科 Dermochelyidae
陸龜超科 Testudinoidae
河龜科 Emydidae
河龜亞科 Emydinae
雞龜亞科 Deirochelyinae
地龜科 Geoemydidae
潮龜亞科 Batagurinae
地龜亞科 Geoemydinae
平胸龜科 Platysternidae
陸龜科 Testudinidae
鱉超科 Trionychoidae
豬鼻龜科 Carettochelyidae
泥龜科 Dermatemydidae
動胸龜科 Kinosternidae
動胸龜亞科 Kinosterninae
麝香龜亞科 Staurotypinae
鱉科 Trionychidae
盤鱉亞科 Cyclanorbinae
鱉亞科 Trionychinae
[編輯] 側頸龜亞目 Pleurodira
蛇頸龜科 Chelidae
側頸龜超科 Pelomedusoidae
側頸龜科 Pelomedusidae
美非側頸龜科 Podocnemididae
[編輯] 喙頭蜥目 Sphenodontia
喙頭蜥科 Sphenodontidae
[編輯] 有鱗目 Squamata
[編輯] 蜥蜴亞目 Lacertilia
[編輯] 鬣蜥下目 Iguania
鬣蜥科 Agamidae
鬣蜥亞科 Agaminae
蠟皮蜥亞科 Leiolepidinae
飛蜥亞科 Draconinae
變色龍科 Chamaeleonidae
領豹蜥科 Crotaphytidae
海帆蜥科 Corytophanidae
櫛尾蜥科 Hoplocercidae
美洲鬣蜥科 Iguanidae
卷尾蜥科 Leiocephalidae
Leiosauridae科
平咽蜥科 Liolaemidae
盾尾蜥科 Opluridae
角蜥科 Phrynosomatidae
變色蜥科 Polychrotidae
脊尾蜥科 Tropiduridae
[編輯] 壁虎下目 Gekkota
雙足蜥科 Dibamidae
壁虎科 Gekkonidae
貓壁虎亞科 Aeluroscalabotinae
擬蜥蜴亞科 Eublepharinae
壁虎亞科 Gekkoninae
沙虎亞科 Teratoscincinae
澳大利亞蜥虎亞科 Diplodactylinae
鱗足蜥科 Pygopodidae
鱗足蜥亞科 Pygopodinae
澳蛇蜥亞科 Lialisinae
[編輯] 石龍子下目 Scincomorpha
環尾蜥科 Cordylidae
蛇形環尾蜥亞科 Chamaesaurinae
環尾蜥亞科 Cordylinae
板蜥科 Gerrhosauridae
板蜥亞科 Gerrhosaurinae
盾蜥亞科 Zonosaurinae
眼鏡蜥科 Gymnophthalmidae
蜥蜴科 Lacertidae
瓜羅蜥亞科 Gallotiinae
蜥蜴亞科 Lacertinae
石龍子科 Scincidae
Acontinae亞科
蝘蜓亞科 Lygosominae
石龍子亞科 Scincinae
美洲蜥蜴科 Teiidae
夜蜥蜴科 Xantusiidae
古巴夜蜥亞科 Cricosaurinae
夜蜥蜴亞科 Xantusiinae
[編輯] 復舌下目 Diploglossa（又譯蛇蜥下目）
蛇蜥科 Anguidae
蛇蜥亞科 Anguinae
肢蛇蜥亞科 Diploglossinae
側褶蜥亞科 Gerrhonotinae
蠕蜥科 Anniellidae
異蜥科 Xenosauridae
鱷蜥亞科 Shinisaurinae
異蜥亞科 Xenosaurinae
[編輯] 厚背下目 Platynota（又譯巨蜥下目）
毒蜥科 Helodermatidae
婆羅蜥科 Lanthanotidae
巨蜥科 Varanidae
[編輯] 蛇亞目 Serpentes
[編輯] 真蛇下目 Alethinophidia
原蛇總科 Henophidia
瘰鱗蛇科 Acrochordidae
筒蛇科 Aniliidae
倭管蛇科 Anomochilidae
蚺科 Boidae
蚺亞科 Boinae
沙蟒亞科 Erycinae
島蚺科 Bolyeridae
管蛇科 Cylindrophiidae
美洲閃鱗蛇科 Loxocemidae
林蚺科 Tropidophiidae
盾尾蛇科 Uropeltidae
閃鱗蛇科 Xenopeltidae
新蛇總科 Xenophidia
穴蝰科 Atractaspididae
遊蛇科 Colubridae
Boodontinae亞科
鐵線蛇亞科 Calamariinae
黃頷蛇亞科 Colubrinae
食蝸蛇亞科 Dipsadinae
水遊蛇亞科 Homalopsinae
遊蛇亞科 Natricinae
鈍頭蛇亞科 Pareatinae
花條蛇亞科 Psammophiinae
斜鱗蛇亞科 Pseudoxenodontinae
Pseudoxyrhophiinae亞科
閃鱗蛇亞科 Xenodermatinae
異齒蛇亞科 Xenodontinae
眼鏡蛇科 Elapidae
蟒蛇科 Pythonidae
蝰蛇科 Viperidae
白頭蝰亞科 Azemiopinae
夜蝰亞科 Causinae
蝮蛇亞科 Crotalinae
蝰蛇亞科 Viperinae
[編輯] 盲蛇下目 Scolecophidia
異盾盲蛇科 Anomalepidae
細盲蛇科 Leptotyphlopidae
盲蛇科 Typhlopidae
[編輯] 蚓蜥亞目 Amphisbaenia
蚓蜥科 Amphisbaenidae
雙足蚓蜥科 Bipedidae
佛羅裏達蚓蜥科 Rhineuridae
短頭蚓蜥科 Trogonophidae
鱷目 Crocodilia
短吻鱷科 Alligatoridae
短吻鱷亞科 Alligatorinae
凱門鱷亞科 Caimaninae
鱷科 Crocodilidae
長吻鱷科 Gavialidae
長吻鱷亞科 Gavialinae
切喙鱷亞科 Tomistominae