主要起義軍：
綠林軍[ 天鳳四年——建武元年（公元25年）]，為新朝末年最大最重要的壹支起義軍。
新朝末年，因為王莽新政的失敗從而激化了社會矛盾。當時新市（今湖北京山東北）人王匡、王鳳兄弟常常為饑民打抱不平，因此獲得了新市壹帶民眾的擁戴。天鳳四年，王匡、王鳳兄弟聚集饑民，發動武裝起義，以綠林山（今湖北當陽東北）為基地，被稱為“綠林軍”。綠林軍起義之後，荊州壹帶紛紛響應，從者甚眾。新朝地皇二年（公元21年），綠林軍擊敗荊州官軍，殺了州牧，隊伍急速擴大。綠林山中大疫，起義軍分兵轉移，壹路西入南郡稱下汀兵；壹路北上南陽稱新市兵，並與另壹支起義軍平林兵會合。其中新市兵在南陽收納了南陽人劉演，劉秀兄弟。新地皇四年（公元23年），綠林軍立西漢宗室劉玄為帝，恢復漢的國號，建元“更始”。接著綠林軍攻占昆陽（今河南葉縣）、定陵（今河南舞陽東北）、郾縣（今河南郾城）等地，並派兵進攻宛城，王莽遂派王邑、王尋率兵反撲，結果爆發了著名的昆陽之戰。最後王尋被殺，新莽軍主力被消滅。綠林軍隨即兵分兩路進攻洛陽和武關。更始元年（公元23）綠林軍攻取長安，王莽被殺死。同年10月劉玄北都洛陽。當時赤眉軍曾打算與劉玄聯手，但是被劉玄回絕。次年，劉玄移都長安後，起義軍發生內訌。劉玄殺害起義將領，王匡等被迫率眾歸附赤眉軍。同時，劉玄錯誤的將劉秀派到河北去招撫其他勢力，結果放虎歸山。更始二年，赤眉軍分兩路進攻更始政權。次年會師弘農（今河南靈寶北），進至華陰時立西漢宗室劉盆子為帝，年號建世。更始三年（公元25年），赤眉軍攻占長安，劉玄投降，不久被絞殺。綠林軍自此覆滅。
赤眉軍[ 天鳳五年——建武三年（公元27年）]，為新莽末年另壹支較大規模的起義軍。
新莽末年，天下大饑，尤其以青州壹帶最為嚴重。天鳳五年，瑯琊（今山東諸城）人樊崇在莒（今山東莒縣）率領100多名饑民起義，得到青、徐（今山東東部和江蘇北部）等州饑民響應，隊伍發展到數萬人。他們約定“殺人者死，傷人者償創”。因把眉毛染成赤色以免作戰時與亂軍相混，故稱為“赤眉軍”。地皇三年（公元22年），王莽派太師王匡。（王莽侄）、更始將軍廉丹率10余萬大軍鎮壓赤眉軍，在成昌（今山東東平東南）為赤眉軍所大敗。廉丹戰死。後赤眉軍轉戰於兗州（今河南省東部）壹帶。更始元年，樊崇聽聞綠林軍已破長安，本欲去與其聯合，但是不料被劉玄拒絕。不久綠林軍即發生內亂，王匡率部出逃，投降赤眉軍，使得赤眉軍力量大增。更始二年，赤眉軍分兩路進攻更始政權。次年會師弘農（今河南靈寶北），進至華陰時立西漢宗室劉盆子為帝，年號建世。更始三年（公元25年），赤眉軍攻占長安，劉玄投降，不久被絞殺。這時，關中豪強地主隱匿糧食，組織武裝頑抗。建武二年（公元26）赤眉軍因糧食斷絕退出長安。次年初，在新安（今河南澠池東）、宜陽（今屬河南壹帶）遭劉秀部圍擊，樊崇被迫投降劉秀。不久，樊崇等再次起義，旋即被鎮壓，赤眉軍徹底瓦解。
2、東漢末起義軍：
黃巾起義 東漢末年張角等領導的大規模農民起義戰爭。起義者頭裹黃巾，故稱"黃巾起義"。
東漢後期，政治腐敗，橫征暴斂,加之災情嚴重,民不堪命，農民紛紛奮起反抗。漢靈帝時，巨鹿(今河北平鄉西南)人張角創立"太平道"，自稱"大賢良師"，以咒符水治病為傳道手段，利用宗教秘密宣傳組織群眾，反抗東漢暴政。十余年間，擁有徒眾數十萬,分布在青、徐、幽、冀、荊、揚、兗、豫等州,並按地域將其分為36方(部)，大方萬余人，小方六七千人，各有首領。還在京城發展道徒和收買宦官，作為起義內應。又以讖語宣揚"蒼天已死，黃天當立，歲在甲子，天下大吉",準備於甲子歲(公元184)三月初五起義。當年正月，張角以大方首領馬元義負責籌調荊、揚數萬人至鄴(今河北臨漳西南)作起義主力，又往來京城打探消息和聯絡徒眾,事為弟子唐周告發,致馬元義被捕車裂，京城地區與太平道關聯者千余人遭害。值此驟變，張角決定提前行動。
二月，張角自稱天公將軍，弟張寶、張梁分別為地公將軍、人公將軍,在冀州起兵,各地黃巾軍相繼而起。南陽地區首領張曼成自稱"神上使",率部攻城,殺太守；首領波才所部攻占潁川郡(治陽翟,今河南禹州)；彭脫部活動於汝南，取召陵(今漯河東北),向潁川靠近；東郡(治今濮陽西南)蔔己部進攻蒼亭(今山東陽谷北)。各路黃巾軍聲勢浩大，發展迅猛，攻占州郡，焚燒官府，京師震動。淮南、巴蜀、涼州等地的起義也相繼爆發，震撼著東漢王朝。
漢靈帝下令赦免黨人，以緩和內部矛盾，並出宮中藏錢分賜官兵，用西園馬匹加強軍隊，又令河南尹何進為大將軍，率左右羽林軍、五營營士屯都亭，在洛陽(今河南洛陽東)外圍的函谷、伊闕、孟津等八關設都尉，以保衛京城。接著，命北中郎將盧植率軍攻張角，以搗毀黃巾軍中樞，又遣左中郎將皇甫嵩、右中郎將朱儁率兵4萬余，鎮壓對洛陽威脅最大的潁川黃巾軍。
四月，波才領導潁川黃巾軍擊敗朱儁軍，乘勝圍攻皇甫嵩於長社(今長葛東北)，使其陷入險境。後因黃巾軍依草結營,戒備不嚴,夜間被皇甫嵩趁風燒營，潰退時又與騎都尉曹操遭遇，損失甚重。次月，遭朱儁、皇甫嵩、曹操合擊，數萬人被屠殺。六月，波才退守陽翟，彭脫至汝南西華(今西華南)，不久均被鎮壓。朝廷隨即派朱儁進軍南陽，皇甫嵩進攻東郡蔔己。八月，在倉亭大戰中，義軍犧牲7000余人，蔔己被俘，東郡黃巾軍失去戰鬥力。
南陽黃巾軍自三月圍攻宛城，同太守秦頡相持百余天。六月，張曼成陣亡，趙弘代為首領，隊伍迅速發展至十余萬，攻占了宛城並堅守至八月，多次粉碎朱儁及南陽、荊州地方武裝的進攻。趙弘戰死，韓忠繼為首領。朱儁佯攻城西南，而自城東北乘虛突入。韓忠退至小城，請降未成，領義軍死戰堅守。後被朱儁撤圍誘出，中埋伏而敗。韓忠投降被殺，余部推孫夏為首領，還城繼續抵抗，十壹月，遭孫堅所部官軍猛攻，率眾轉移至西鄂(今南陽北)西南，兵敗精山，萬余人慘遭殺害。
河北黃巾軍在張角領導下，不斷獲勝。三月，與盧植官軍交戰後,初有失利。張角令張寶守下曲陽(今河北晉州西)，自與張梁守廣宗(今威縣東),成犄角之勢。盧植不能克。繼又擊敗東中郎將董卓的圍攻。十月，朝廷調皇甫嵩代董卓，繼續攻廣宗。此時張角病故，張梁為統帥，率部激戰，又將其擊退。後因戒備松懈，遭到夜襲，兵敗城破，張梁受害，被殺者3萬人，不降而投河者5萬余人。次月，孤城下曲陽也被皇甫嵩攻破，張寶陣亡，十余萬人遭屠殺。
黃巾軍幾支主力被鎮壓後，分散各地的余部仍堅持鬥爭。青州黃巾軍至初平三年(192)壹度擁眾數十萬；活動於西河郡(治今山西離石)白波谷壹帶的黃巾軍攻太原、河東，曾大敗董卓軍。在黃巾起義影響下興起的黑山軍，也取得多次勝利。起義軍此伏彼起，堅持鬥爭20多年。
黃巾起義目標明確，組織周密，動員廣泛，鬥誌旺盛。但起義後即失去統壹指揮，各自為戰，以分散的力量對付集中之敵，且單純防禦，被各個擊破。這壹大規模的起義，動搖了東漢王朝統治。