多次退火環狀循環擴增技術（Multiple annealing and looping-based amplification cycles，MALBAC）結合了MDA法與PCR方法的特點，使用的35 nt長的引物，由壹段固定的27 nt通用引物序列和8 nt隨機堿基序列（N8）組成，在0℃時該8 nt隨機堿基序列可與模板任意退火，梯度升溫至65℃後在具有鏈置換活性的Bst大片段DNA聚合酶作用下發生鏈置換聚合反應，得到壹系列長度不壹的（0.5-1.5 kb）半擴增子（Semiamplicons），在94℃變性、0℃退火以及65℃延伸循環後，上壹循環中半擴增子形成了兩端具有互補結構（27 nt）的全擴增子（Amplicons），隨後降低溫度至58℃使得到的擴增子兩端互補形成loop結構，從而可以避免引物與其進行結合導致全擴增子倍增導致的不均衡擴增，因此可以很大程度上保證該循環發生的是線性擴增。在經過5個上述類似線性擴增循環後可得到大量全擴增子並做為接下來PCR反應的模板，並使用該27 nt通用引物進行指數PCR反應，因此只有全擴增子才能得到有效擴增，從而實現對整個基因組的高效而又均衡的全擴增
謝曉亮教授在Science上的報告了壹種改進的單細胞的WGA法：通過轉座子插入進行線性放大。DNA被含有T7啟動子的Tn5轉座子隨機片段化，T7啟動子允許線性擴增。LIANTI法優於現有的方法，能在千堿基分辨率進行微CNV檢測。這允許直接觀察從細胞到細胞不同的，隨機發生的DNA復制起始。
1.潘孝明, 梁興國. 全基因組擴增技術原理及研究進展[J]. 生物技術通報, 2014 (12): 47-54.