分子篩效應：大分子進不去先出去，小分子後出去；凝膠電泳根據帶電分子在電場中受力不同以致移動速度不同從而實現分離；因此分子大小適中都可以進進入層析柱中的空隙。
利用具有網狀結構的凝膠的分子篩作用，根據被分離物質的分子大小不同來進行分離。層析柱中的填料是某些惰性的多孔網狀結構物質，多是交聯的聚糖類物質。
小分子物質能進入其內部，流下時路程較長，而大分子物質卻被排除在外部，下來的路程短，當壹混合溶液通過凝膠過濾層析柱時，溶液中的物質就按不同分子量篩分開了。
擴展資料：
當壹種分子被放置在電場當中時，它們就會以壹定的速度移向適當的電極，這種電泳分子在電場作用下的遷移速度，叫做電泳的遷移率。
同電場的強度和電泳分子本身所攜帶的凈電荷數成正比。也就是說，電場強度越大、電泳分子所攜帶的凈電荷數量越多，其遷移的速度也就越快，反之則較慢。
由於在電泳中使用了壹種無反應活性的穩定的支持介質，如瓊脂糖凝膠和聚丙烯酰胺膠等，從而降低了對流運動，故電泳的遷移率又是同分子的摩擦系數成反比的。
百度百科——凝膠過濾層析
百度百科——凝膠電泳