1980年，佩德羅·阿莫多瓦根據自己為壹本科幻雜誌編寫的同名色情小說，編導了第壹部登堂入室的喜劇片《烈女傳》，該片是壹部性感的諷刺劇，給了佛朗哥時代的西班牙社會壹記響亮的耳光。
1982年，佩德羅·阿莫多瓦推出了他第二部編導的喜劇片《激情迷宮》，化著濃妝、穿著女性服裝，大膽地以女人的造型出現，影片中體現出了那種及時行樂以及性亂的題材 。
1983年，佩德羅·阿莫多瓦編導了喜劇片《黑暗的習慣》，該片中探索了那些生活在社會邊緣的修女們的生活，描述壹位婦女被迫當修女的故事 。
1984年，佩德羅·阿莫多瓦編導喜劇片《我為什麽命該如此?》，該片講述了家庭主婦日常生活的辛勞，內心的痛苦與掙紮的故事 。
1986年，編導劇情片《鬥牛士》，由安東尼奧·班德拉斯主演，該片探索了性和死亡的關系，並向觀眾描繪了多種性關系，更加深入了演繹的性欲及相關的法律問題 。
1988年，編導喜劇片《崩潰邊緣的女人》，由安東尼奧·班德拉斯主演，該片涉及到了對女性的性特征和欲望的敏感題材，並在國內市場上創下了780萬美元的票房收入 。
1987年，佩德羅·阿莫多瓦與弟弟阿古斯汀·阿莫多瓦組建了家族式"欲望無限"電影制作公司 。
1990年，佩德羅·阿莫多瓦編導了情色片《捆著我，綁著我》，該片講述了壹位著名的女影星愛上了綁架、並劫持她為人質的歹徒的故事 。
1991年，佩德羅·阿莫多瓦自編自導劇情片《情迷高跟鞋》，由維多利亞·阿布裏爾、瑪麗莎·佩雷德斯、哈維爾·巴登主演 。
1993年，自編自導愛情片《基卡》 。
1995年，佩德羅·阿莫多瓦改變了編導風格，推出了心理片《窗邊的玫瑰》。同年，執導倫理片《顫抖的欲望》，由賈維爾·巴丹主演，該片改編自魯思·倫德爾的同名小說，探索了愛情、迷失和苦難 。
1999年，佩德羅·阿莫多瓦自編自導劇情片《關於我的母親》，由貝特·戴維斯、羅米·施奈德和吉納·羅蘭主演，佩德羅·阿莫多瓦獲得了第52屆戛納電影節最佳導演獎，以及第53屆英國學院獎最佳導演。該片講述了女主角為車禍身亡的兒子尋找素未謀面生父的故事，獲得了第57屆金球獎和第72屆奧斯卡獎的最佳外語片 。
2002年，佩德羅·阿莫多瓦自編自導關於友情、愛情、寂寞、生存和交談的劇情片《對她說》，獲得了第15屆歐洲電影獎、洛杉磯影評人協會最佳導演，第56屆英國學院獎最佳編劇，以及第75屆奧斯卡獎最佳導演和最佳編劇的提名，該片講述了兩個男人如何愛女人的故事 。
2004年，拍攝驚悚愛情片《不良教育》，·該片是2004年戛納電影節的開幕式影片，也是在開幕式上映的第壹部西班牙影片，故事結構耗費了佩德羅·阿爾莫多瓦10年時間才完成 。
2006年，自編自導喜劇片《回歸》，由佩內洛普克魯茲、勞拉·杜納絲主演。
2009年，執導愛情驚悚片《破碎的擁抱》，由路易斯·霍馬、魯本·奧錢蒂諾、佩內洛普·克魯茲主演，該片為佩德羅·阿莫多瓦的第17部影片，使用了大量年輕的音樂人來為電影配樂，入圍了第62屆戛納電影節主競賽單元 。
2011年，執導劇情片《吾棲之膚》，由安東尼奧·班德拉斯、埃琳納·安娜亞主演，該片入選了第64屆戛納電影節的主競賽單元 。
2013年，執導愛情喜劇片《我超興奮》，由絲莉亞·洛芙、加維埃爾·卡馬拉主演 。
2014年，擔任喜劇片《荒蠻故事》的制作人，該片首映於2014年戛納電影節主競賽單元，後獲得87屆奧斯卡最佳外語片的提名和第67屆戛納電影節金棕櫚獎提名 。