受多年凍土區隔水作用影響，裂隙水的補給與排泄具有自身的特征。連續多年凍土區，淺層部位的風化裂隙水可直接接受大氣降水與地表水的補給，也有遠區的含水層補給，通過蒸散作用，補給其他含水層或以泉的形式排泄(圖9.18)。埋藏於多年凍土層下的裂隙水，多為成巖裂隙水或構造裂隙水，多通過較遠的融區水補給或排泄。連續多年凍土區裂隙水多以構造裂隙水、成巖裂隙水為主，裂隙含水層的補給區、排泄區與裂隙水的分布區不壹致，補給與排泄方式單壹。
圖9.18 長江源區布曲附近的基巖裂隙凍結層上水剖面圖(據地質礦產部906水文工程地質大隊，1990)
在不連續島狀多年凍土區，裂隙水島狀凍土區深層裂隙水可通過斷裂融區或河湖融區進行補給或排泄，也可以通過融區與淺層地下水之間垂向補給或排泄。裂隙水補給或排泄方式較復雜。
多年凍土區裂隙水主要集中的部位除了構造應力或自重應力集中的部位裂隙最為發育外，融區分布是最重要的因素。裂隙水最富集地帶有:①裂隙水的融區發育帶。主幹河流、湖泊、主斷裂融區發育的地帶;融區斷裂(主幹裂隙)是主要導水通道，地下水容易得到補給，交替速度較快，其周圍次級裂隙，其裂隙率高，可以成為地下水的主要儲集空間。②構造應力集中帶。張性或張扭性斷層帶以及斷裂帶周圍的節理密集帶，呈帶狀分布;背斜軸部縱裂隙、橫裂隙、層面裂隙發育帶，含水層呈脈狀;夾於塑性巖層中的脆性巖層，往往發育密集而均勻的張開裂隙，成層狀含水層。③自重應力作用集中帶。風化殼尤其是其淺層部位的裂隙富集帶，含水層呈殼狀分布。