經過孔子幾十年的工作，他親手完成了六種古籍的整理和編纂。
(壹)《詩》：後稱《詩經》，包括“頌”(周、魯、宋的宗廟祭祀樂歌)、“雅”(貴族創作的歌詩)、“風”(十五個國家和地區的民間歌詩)，編集了距今兩千五百年至三千年之間的歌詩***305篇。這是中國由口頭文學轉化為書寫文學的第壹部詩集，被稱為中國文學的源頭，與希臘史詩、莎士比亞戲劇並稱世界古代三大文學名著。孔子不但對這本詩集的歌詩進行收集、整理、校勘，還進行正樂(校正音律)和語言規範化的處理。《論語》中有他教學生讀《詩》以及他用《詩》和講《詩》的記錄。
(二)《書》：即《尚書》，又稱《書經》，是夏、商、周三代歷史檔案文獻。《尚書》就是上古的書，上起堯舜，止至東周，是中國最早的政事史料匯編，記錄了距今四千年到兩千六百年間的若幹政事活動，涉及政治、軍事、哲學、宗教、法律、地理、歷法等諸多領域，是研究古史不可缺少的歷史文獻資料。據《緯書》說，《尚書》原有3240篇，經孔子輯佚整理，得120篇；據《漢書藝文誌》記載，漢代時還有100篇，經魏晉南北朝又有散佚，現僅傳58篇，包括《虞書》5篇、《夏書》4篇、《商書》17篇、《周書》32篇。
(三)《易》：即《周易》。原本是蔔筮用書，但它含有豐富的哲學思想，也有許多社會史料和文學資料。孔子不迷信鬼神，也從不占蔔。他五十歲時鉆研《周易》，發現了它的哲學價值。《論語述而》第十七章記錄：“子曰：加我數年，五十以學《易》，可以無大過矣。”他讀《易》曾“韋編三絕”。據說，他為講解《易》，寫了《周易大傳》，發掘《易》的哲學內涵，孔子是第壹位把《易》作為哲學來讀、來講的學者，從而確定了這部文獻在中國傳統文化中的地位。
(四)《禮》：又稱《禮經》，實際指《儀禮》17篇。(後來“十三經”中的三《禮》，指《儀禮》、《周禮》、《禮記》。《周禮》是戰國人編的，《禮記》是漢代人編的禮學論文集。)這17篇，全是周代禮儀的詳細記錄，記錄婚、冠、喪、祭等禮節儀式的過程及其具體安排，其中保留了我們民族原始禮儀的若幹成分。《儀禮》是孔門弟子從事司禮活動的依據，其中若幹成分壹直沿襲到現代的禮俗活動之中。
(五)《樂》：又稱《樂經》。孔子特別愛好音樂，也精通音律。他認為音樂的功用是陶冶人的情操，激發人的情感。如何運用音樂，既關系人的意誌，也影響社會風氣和國運興衰，所以他推重壹些樂曲，也堅決反對壹些樂曲。《樂經》是他推崇的樂曲的曲譜，也有壹部分理論說明文字。到漢代時，《樂經》已經失傳。
(六)《春秋》：《春秋》本來是魯國歷代史官逐年逐月大事記的名稱，孔子依據魯國的史記，參考其他國的史冊，以魯國紀年及十二公年次為序，進行整理修纂，記載了公元前722年至公元前481年***242年間各國史事1800多條。因為孔子編著的這本書，中國歷史分期便把這個時期稱為春秋時期。孔子將其作為教學用書，就是當時的近代史教材。它用的魯國紀元，記的是這壹歷史大變革時期的各國之事，書中記的都是原始記錄，經後人考證，所記的天象壹壹符合現代的科學推算，再驗證出土文物和他國史書，記事可作為可信的歷史資料。孔子編修《春秋》，並非只是抄集各國的史官記事，也非單純記述史事，而是“以述代作”，在記述中表現出他的政治主張。司馬遷《史記》說：孔子“是非二百四十二年之中，以為天下儀表，貶天子，退諸侯，討大夫，以達王事而已”。後人把書中表現的政治思想，稱為“春秋大義”；把他壹字不茍、字寓褒貶的嚴謹筆法，稱為“春秋筆法”；《春秋》的義理和筆法，都對後世影響深遠。《春秋》文字簡約，最長的壹條記事，也只有23字，讀《春秋》必須有“傳”、“記”作解釋和補充，才能夠明了。通行的傳記有《春秋左氏傳》(簡稱《左傳》)、《春秋公羊傳》、《春秋穀梁傳》，後世將經和傳合編，《春秋》三傳均列入“十三經”。
學者孔丘整理編修以上六種古籍，為中華民族保存了珍貴的上古文獻，而且成為世界文化遺產。孔子是中國古代第壹位成績巨大的古文獻整理專家。
教師孔丘用這種教材教授學生，用《詩》作文學和語言教材，用《書》作政治教材，用《易》作哲學教材，用《禮》作禮儀教材，用《樂》作音樂教材，用《春秋》作近代史教材。