表觀遺傳調控機制是生命現象中壹種普遍存在的基因表達調控方式,主要有以下幾種:
1.DNA甲基化 :
在DNA甲基化轉移酶的作用下將甲基選擇性地添加到DNA分子上,DNA化學修飾的壹種形式,能在不改變DNA序列的前提下,改變遺傳表現;
在DNA甲基轉移酶的催化下,DNA甲基化被認為是原核生物和真核生物基因組中最豐富的復制後核苷酸修飾形式。
2.DNA去甲基化 :
細胞中缺乏和減少細胞內的DNA甲基轉移酶含量會引起DNA的去甲基化;
3.組蛋白修飾 :
組蛋白在相關酶作用下發生甲基化、乙酰化、磷酸化、泛素化等修飾的過程;
4.染色質可接近性 :大多數基因組中的染色質都緊密圍繞在細胞核內,但也有壹些區域經染色質重塑後呈現出松散的狀態,這部分DNA區域被稱為開放染色質或可接近性染色質。染色質是否呈疏松結構是決定轉錄功能的關鍵因素;
5.非編碼RNA調控 :microRNA抑制轉錄後水平的基因表達而誘導功能缺失表型,長鏈非編碼RNA(IncRNA)、環狀RNA(circRNA)調控;
6.蛋白DNA互作 :
表觀遺傳測序(Epigenetics Sequencing):
表觀遺傳測序是利用高通兩測序,研究DNA修飾、基因表達及調控發生的可遺傳變化。根據研究對象分為DNA和RNA兩大類,進壹步可劃分為化學修飾、與蛋白質相互作用這兩個主要細分領域。
染色質免疫***沈澱測序chip-seq、全基因組甲基化測序WGBS
Reference:
⑴ The molecular circuitry of brassinosteroid signaling.