1、使用電腦打開國家規定的電子網絡發票應用系統，登錄個體賬戶之後，點擊選中平時的發票開具選項，有發票作廢該選項，在通過選擇要作廢的發票所在的日期，鎖定要作廢的發票對象；
2、完善相關的發票代碼和信拆數號碼，寫明白作廢原因；
3、點壹下作廢按鍵完成電子發票作廢。
電子發票是信息時代的產物，同普通發票壹樣，采用稅務局統壹發滑首放的形式給商家使用，禦租發票號碼采用全國統壹編碼，采用統壹防偽技術，分配給商家，在電子發票上附有電子稅務局的簽名機制。電子發票與傳統紙質發票相比，網絡發票管理系統可以在線開票，節省發票工本費、稅控機成本以及相關人力成本。
企業進行工商註銷前，壹般要進行稅務註銷，稅務註銷時會進行企業所得稅清算，之後才可以辦理稅務註銷。
剩余的發票如果在稅務註銷之前已經開具，那麽還是有效發票，可以進行正常的認證和抵扣，註銷後180天內有效。如果稅務註銷後，那麽已經無法開具增值稅發票，剩余發票即是空白發票，這些發票在當時領用時已經報稅務局備案登記。
那麽空余發票相應也要去稅務機關進行繳銷才可以，所有已經開具發票為防止萬壹要辦理驗舊，否則是辦理不了稅務註銷的。這樣做的原因是主要是稅務部門為了防止有些企業利用發票實施壹些違法行為偷漏稅款。
法律依據：
《中華人民***和國發票管理辦法》
第七條 增值稅專用發票由國務院稅務主管部門確定的企業印制；其他發票，按照國務院稅務主管部門的規定，由省、自治區、直轄市稅務機關確定的企業印制。禁止私自印制、偽造、變造發票。
《中華人民***和國電子商務法》
第十四條電子商務經營者銷售商品或者提供服務應當依法出具紙質發票或者電子發票等購貨憑證或者服務單據。電子發票與紙質發票具有同等法律效力。