附：
方舟子的打假很多都直指中國國家研究部門和高校的著名教授、高級領導。其中比較著名的事件包括：
朱涵事件
朱蘇力招生事件
基因皇後陳曉寧事件
民工打磨漢芯事件
“昏教授”肖傳國事件
西安翻譯學院丁祖詒事件
四川大學教授丘小慶事件(鬧劇，《新語絲》發文者向丘小慶公開賠禮道歉)
四川大學中國科學院院士魏於全事件
東南大學校長及中國工程院院士顧冠群事件
南京大學新聞傳播學院教授潘知常事件
2005年9月14日指出“肖氏反射弧”未獲國際公認
2005年11月清華教授劉輝學術造假
2007年4月蒙牛造骨牛奶蛋白（OMP）事件
2010年7月唐駿學歷造假事件
2010年7月28日神仙李壹現形記
2010年8月28日質疑“國學天才”孫見坤剽竊作品
2010年9月16日質疑劉維寧首席科學家身份
2010年12月稱張衡當年建造的地動儀“很可能和今人復原的那些模型壹樣，僅僅是個擺設”。
2011年07月質疑非誠勿擾綜合節目主持人樂嘉的學位造假和色彩理論剽竊。
2012年07月爆料廈門大學傅瑾女教授學位造假(已辭退)
2012年10月9日猛批360泄露隱私，遭遇360誹謗，10月17日，方舟子稱已起訴奇虎360公司損其名譽。工信部介入調查