生物醫學工程最好的大學排名如下：
東南大學
2.華中科技大學
3.上海交通大學
4.清華大學
5.北京航空航天大學
1.東南大學
是教育部直屬高校，位列985工程、211工程、世界壹流大學建設高校，入選2011計劃、珠峰計劃、111計劃、卓越工程師計劃，為中俄交通大學聯盟、卓越大學聯盟等聯盟重要成員。學校擁有交通運輸工程、生物醫學工程等5個壹級學科國家重點學科，在生物醫學工程、電子信息、土木建築等領域學科實力強勁
2.華中科技大學
是中華人民***和國教育部直屬的綜合性研究型全國重點大學、位列國家“雙壹流”、 “985工程"、"211工程"、入選"強基計劃"、"111計劃"、卓越工程師教育培養計劃、卓越醫生教育培養計劃、湖北省2011計劃、國家大學生創新性實驗計劃、國家級大學生創新創業訓練計劃、國家建設高水平大學公派研究生項目、國家級新工科研究與實踐項目。
基礎學科拔尖學生培養計劃2.0，是學位授權自主審核單位、全國深化創新創業教育改革示範高校、壹流網絡安全學院建設示範項目高校、中國政府獎學金來華留學生接收院校、教育部來華留學示範基地，為中歐工程教育平臺成員和醫學“雙壹流”建設聯盟、中國人工智能教育聯席會理事單位。