病歷質量控制涵蓋整個業務環節，每個環節都需要認真做好相關工作，互相配合，互相監督，保證質量，避免糾紛。質量控制項目主要在工作時間和內容方面進行，按時高質量完成。
在醫院質量評價體系中，定義了醫療質量的三個環節:基礎質量、環節質量和最終質量。基本素質貫穿於質量管理的全過程，必須常抓不懈；環節質量直接影響整體醫療質量，必須高度重視；終端質量是基礎質量和環節質量的綜合結果，起到質量反饋控制的作用。
在電子病歷業務系統中的實際應用也涵蓋了這三個環節，分別是:臨床業務科室醫生自評、科室醫生病歷質量控制、醫務科或質控科醫院級病歷質量控制、病案科終末病歷質量控制。
臨床業務科室醫生自我評價是整個病歷質量控制的第壹道防線。醫生根據質控部門或醫務部門制定的質控標準進行自我評價，第壹時間發現病歷質量存在的問題並予以糾正。
科室質控醫師病歷質量控制是整個科室質量控制的重要環節。上級(醫務科或質控科)可以保證本科室的病歷質量已經統計上報，下級(醫師)可以控制，防止潛在問題。
醫務科或質控科對醫院級病歷的質量控制是質量控制的最後壹道坎。質控醫生可以對全院各科室的病歷進行抽查，壹是檢查病歷質量，二是評價各業務科室質控員的工作。
病案科進行最終病歷的質量控制，而這個質量控制的控制是最重要的，因為病案科質量控制後的數據需要上報給其他醫療機構，比如病歷首頁的數據需要上傳到醫療管理部門、衛生系統、drgs等等。還有壹點，高效優質的質控也可以避免醫療糾紛。