1927年2月，卓愷澤被選為***青團江浙區委委員，負責宣傳工作。在上海工人第三次武裝起義時，他在周恩來同誌的領導下，參加了武裝起義的宣傳工作，起草了《宣言》、《告民眾書》以及標語口號、傳單等。他傑出的工作能力和奮鬥精神給周恩來同誌留下了深刻的印象，他犧牲以後，周恩來曾專門作文悼念。
同年5月，***青團第四次全國代表大會在武漢召開。卓愷澤出席了大會，並當選為團中央委員。大會閉幕以後，他留在武漢團中央宣傳部工作。八九月間，團中央派卓愷澤到江浙兩省指導工作，他奔波於上海、杭州等地，宣傳黨的工作方針。
1927年9月27日，卓愷澤參加在杭州召開的黨的活動分子會議，被選為中***浙江省委委員。會後不久，省委書記張秋人被捕，在極其危險的情況下，卓愷澤仍堅持了在杭州的地下鬥爭。10月，省委派卓愷澤去寧波指導工作。他回到家鄉松嶴，帶了家眷，在寧波西門附近租房子居住，以家眷作掩護，進行秘密活動。
卓愷澤首先整頓了寧波黨、團組織，接著召集寧波市委全體會議。根據黨的指示和寧波具體情況，他在會上就學運、工會名稱、商民協會和婦女運動等問題提出了自己的意見。會議討論通過了這些意見，並向中央作了報告。
在進行組織整頓的同時，他還利用黨的聯絡點開展工作。到鄉村、學校找黨、團員開座談會。深入了解各方面的情況，和大家壹起分析形勢，動員大家武裝起來，宣傳：“革命需要武裝，要用武裝的革命來對付武裝的反革命”的道理。
面對著第壹次國內革命戰爭失敗後的嚴重形勢，為了挽救革命的失敗，中國***產黨組織領導了八壹南昌起義，打響了武裝反抗國民黨反動派的第壹槍，緊接著，中***中央又在漢口召開了具有歷史意義的八七會議。中***浙江省委為貫徹中***八七會議確定的實行土地革命和武裝反抗國民黨反動派的方針，制訂了在全省各地發動武裝暴動的計劃。卓愷澤對武裝暴動十分積極，他壹面派黨員幹部去慈溪北鄉工作，進行“重建黨支部，從聯系農民骨幹入手，組織農民，建立武裝，舉行秋收起義，奪取政權”的組織和準備工作，壹面帶領曹鴻塘、柴水香、周鼎、史東標、張雪痕等，去鄞南組織暴動委員會。
就在全省各地緊鑼密鼓地進行暴動準備工作之時，11月，浙江省委突然遭敵人破壞，王家謨、貝介夫、徐瑋等省委領導成員被捕。在這壹關鍵時刻，中***中央派夏曦、卓愷澤等重建浙江黨、團省委。由於敵人搜捕甚嚴，新省委在杭州無法立足，便遷移到寧波秘密辦公。此時，卓愷澤擔任團浙江省委書記，為恢復和發展浙江的團組織，籌辦經費和槍支彈藥，用武裝反抗國民黨反動統治而日夜奔波操勞。當他得到消息說，松嶴黨支部的部分同誌在敵人的白色恐怖下有些動搖時，他立即趕到松嶴，教育黨員說：“要頂住逆流，戰勝風浪，堅持鬥爭”；“即使只剩壹個人，也要革命到底，春草會抽芽，革命壹定勝利”，及時鼓舞了大家鬥爭的鬥誌和信心。為籌集暴動經費，卓愷澤去他姐夫和外婆家裏要來近千元錢；還動員父親變賣家產，資助革命，也籌來幾百元錢。
12月，卓愷澤接到團中央通知，要他帶家眷作掩護去上海工作。他帶著妻子、兒子離開了家鄉。到了上海，並很快設法搞到12支手槍和12支木殼槍，每支槍各配100發子彈，用木箱包裝，秘密地托壹只經商的帆船帶到松嶴；另外又搞到幾支手槍，派鄔景和史東標送到家鄉，為奉化暴動創造了條件。
1928年3月，中***湖北省黨、團機關遭國民黨反動派破壞。卓愷澤被任命為團中央特派員兼團湖北省委書記。在當時漢口形勢逆轉，國民黨反動派瘋狂血腥屠殺***產黨人，每天都有大批***產黨和革命誌士慘遭殺害。局勢萬分危急的情況下，卓愷澤對妻子林文翠說：“武漢局勢，確如壹幢將傾的大廈，但總要有人去支撐，怎能眼看著它倒下去?就是必死，我也要去!”他服從黨的派遣，偕妻攜子趕赴武漢。
由於省委內部壹個交通叛變，使湖北黨團組織又遭到了第二次破壞，1928年4月19日下午，卓愷澤正在武昌召開秘密會議，不幸當場被捕。隨後，殘暴的敵人將他妻和兒子也抓了起來。卓愷澤在獄中堅貞不屈，忍受著敵人的拷打，不吐露黨的機密。他還鼓勵妻說：“我決心壹死，妳不要難過，要堅強地生活下去。”他在給父母的信中寫道：“人總不免壹死，死是最尋常的事。死於槍彈之下，更其比死於床褥之間的痛快而有意義。……我生時，因奔走各地，不克對我親愛的父母有很好的物質與精神的安慰。但我想，明白的父母決不會以此責恨我。‘為公忘私’，‘為國忘家’，是古有格訓的。……父母!妳們樂天知命的等著光明的來到吧!”這些話語，充分表現了壹個***產黨員為革命視死如歸的偉大胸懷。
26日晨，卓愷澤從牢獄中出來，大義凜然地走向刑場，高呼口號，慷慨就義。犧牲時年僅23歲。
11月14日，卓愷澤犧牲半年多後，***青團機關刊物《列寧青年》刊登了悼念卓愷澤的文章，稱贊他的“這種大無畏的精神和坦白爽直的胸襟是值得每個革命青年模仿的”。