從政治上講，南明沒有號召力。晉元帝司馬睿建立東晉，盡管得國不正，但司馬王室宗親要麽死於八王之亂，要麽死於五胡南下。司馬睿有晉湣帝封的侍中、左丞相、大都督陜東諸軍事的稱號，利於穩定局面對抗北朝。趙構和司馬睿類似，北宋宗親被金兵擄走，他本人有欽宗封的天下兵馬大元帥的稱號，趙構即位合乎法統。
明朝亡國後有東晉和南宋的先例，按理說更容易出現割據半壁江山。但明朝亡的突然，崇禎自縊前甚至沒有指定繼承人。朱由校和朱由檢都沒有兒子或者離奇失蹤，南京的機構十分健全，但就是差壹個正統有號召力的皇帝人選。南方各地藩王不少，但卻誰都不服誰，導致南明內部始終無法像東晉、南宋壹樣凝聚起來。
從外部對手上來講，南明的對手更強。東晉立國之初非常虛弱，但漢人仍掌握了不少地盤，並州、幽州、涼州、漢中等，而且胡人占據中原和關中後內耗不斷，沒有南下滅東晉的能力。南宋建立時，金國內部對於滅宋存在爭議，給了南宋喘息的機會。西夏的崛起、西遼和北方漢人的不穩定，使金國最終放棄了滅南宋。
而南明面對的情況完全不同，李自成、張獻忠雖然有實力，卻沒有建立有效的統治。清朝則與蒙古達成聯盟，並降服了朝鮮，徹底解除了後顧之憂。清軍漢化的速度遠超北魏、金、蒙，入關之後打出“天下取自於賊，而非明”的口號，李自成滅了明朝，清朝滅了李自成奪取天下，以此宣告明朝已亡，不承認南明的合法性。這樣就削弱了南明朝廷的凝聚力以及北方文人和軍人的南向力度，減少了抵抗力量，從輿論心理上占了優勢。
從漢人士族以及內部民心來講，五胡亂華與金滅北宋，都曾大肆屠殺無辜，漢族士紳望族乃至普通平民對其充滿仇恨感，他們大量南逃，支撐了東晉和南宋政權。南明時代已經不壹樣了，清朝統治者策略比較隱晦和高明，盡管清軍屠殺不亞於五胡，但沒有出現衣冠南渡。此外華夷之辨逐漸淡薄，只要入主中原的異族人能夠崇儒，士族和百姓都能夠接受。
從軍事上來說，東晉有不斷南下的流民和南北士族武裝，並建立了著名的北府兵。南宋有退入四川的陜西六路軍，趙構召集的大量勤王軍隊，以及宗澤留下的東京留守司，自保是綽綽有余的。再看下南明，明軍主力盧象升、孫傳庭戰死，袁崇煥早就被殺，關寧鐵騎跟隨吳三桂降清。其他如大順、大西的殘部多是烏合之眾，南明指揮不了的江南四鎮，將領如高傑、左良玉等，大多誌大才疏、擁兵自重，難以形成有效的抵抗。
明朝滅亡後，南明據有淮河以南半壁江山抵抗清兵，但南明已經失去了天時地利人和，清軍無後顧之憂，進軍速度太快，南明猝不及防。南明經歷了弘光政權、魯王監國、隆武政權、紹武政權、永歷政權，以及明鄭時期，最終為清所盡滅。南明的歷史值得研究，清軍進兵神速的時候，南明內部還在內訌，也是南明滅亡的重要原因之壹！