光祖早期活動
1906年（清光緒三十二年），光祖學堂創辦，提出“家國之光”辦學理念。
1911年，辛亥革命爆發，學堂師生參加遊行示威，響應起義。
1926年，學校教師廖其恭在學堂成立“青年新社”，積極參與新文化運動。
1926年，學堂始辦中學，開廣東鄉辦中學之先河；同年，港僑黃炳（黃伯欣）捐贈二層課室教學大樓壹座，學校為留紀念，取名“伯欣堂”。
1928年，廣東省教育廳贈送學堂“造就國民”扁額壹幅。
1935年，因社會經濟雕敝，僑匯短缺，中學停辦，改為完全小學。
抗日戰爭至建國初期事件
1936年1月，在光祖中學召開“生活讀書會”成立大會。口號是：讀書不能離開生活，生活不能離開理論的指導。
“生活讀書會”成立以後，積極開展抗日救亡和反對封建迷信的宣傳工作，開辦農民夜校、識字班，教群眾唱救亡歌曲《義勇軍進行曲》、《松花江上》等，積極組織抗日話劇、街頭宣傳、化裝遊行等。
1937年，抗日戰爭全面爆發，學堂進步青年投筆從戎，師生在校內集會種樹，“約期十年，必雪國恥”，此樹至今仍蒼勁挺拔。
1937年暑假，學校教師陳誌期、古曼心等聯合淡水愛國青年黃固成立了“淡鋒社”，發表了《告淡水同胞書》，宣傳抗日思想。
1950年初，學校校名改為秀新小學。
1950年，朝鮮戰爭爆發，學堂師生參加抗美援朝“和平簽名運動”。
20世紀60年代初至文革時期事件
1963年，響應毛主席號召，學堂掀起學雷鋒活動熱潮。
1966至1976年，文化大革命，學堂史料遺失殆盡，部分教師被打成“牛鬼蛇神”和“右派”。
新時代主要事件
1982年，隨著深圳經濟特區的成立，復辦中學。
1995年，在學堂原址興建辦公大樓和實驗大樓。
1999年，學校評為龍崗區壹級學校。
2002年，學校評為深圳市壹級學校。
2003年，可容納35個教學班的教學大樓建成；同年，學校評為廣東省壹級學校，坑梓鎮評為廣東省“教育強鎮”。
2002年，坑梓鎮委、鎮政府新壹屆領導班子成立，提出創建“教育強鎮”的宏偉目標。鎮委書記鐘華興、鎮長張慶源提出光祖中學創建省壹級學校的明確要求，鎮政府集資2000多萬元用於學校建設，光祖中學進入跨越式發展階段。
2002年，學校建成校園網，裝備220臺計算機和30個教學平臺，學校信息化建設突飛猛進。
2002年10月，學校晉升為深圳市壹級學校，並獲區教育系統先進單位。
2003年，校園廣場，標準化塑膠運動場，半山網球場，生物地理園，可容納35個教學班的教學大樓相繼建成，配套設施日臻完善，校容校貌得到根本性的改觀。
2003年9月，學校被評為深圳市教育系統先進單位和深圳市文明建設示範單位；11月，學校晉升為廣東省壹級學校。
2004年6月，鐘丹慧同學獲龍崗區中考狀元。
2004年9月，學校獲創建廣東省教育強鎮區先進單位。
從2002年開始，學校先後派遣張振明、李文珍、謝燕娟、李青海等老師到澳大利亞、加拿大、美國等地進修學習；遊福有、朱會坤、謝燕娟等老師被評為深圳市中青年骨幹教師。
2005年，學校積極開展黨員先進性教育活動。學校積極探索教育內涵式發展之路，努力構造“和諧校園”、“活力校園”。