首次辦理須本人至戶籍所在地的出入境管理處提交申請，申請材料有：
1、居民身份證及復印件（用A4紙復印，可復印在同壹張紙上）
2、填寫《中國公民出入境證件申請表》
3、2寸淡底色彩照2張（也可現場拍照，費用自付）
4、同時分別申請赴香港、澳門的簽註。只去香港則申請香港簽註，只去澳門則申請澳門簽註，如果香港、澳門都去，則兩地簽註都要申請。
辦理時限自受理之日起10個工作日（首次或非首次申請）。但均不含郵遞日（壹般在五天左右）以及節假日。
費用《往來港澳通行證》每本80元；壹次往來簽註，每個15元，二次往來簽註，每個30元。
領取方式
本人領取：憑本人申請回執單及繳費收費，並攜帶身份證或戶口薄，到受理申請的出入境管理處領取。
他人代理：代理人攜帶申請回執單，本人身份證、通行證申請人身份復印件到出入境管理處領取。
EMS上門：在辦理港澳通行證當天憑申請回執單到出入境管理處郵政速遞櫃臺辦理手續並繳費。
壹、續簽：
本人憑身份證及有效的《往來港澳通行證》辦理，也可代辦，代辦人需攜帶身份證。（不同城市對加簽可能有特殊規定，具體咨詢戶籍所在地出入境管理處，少數城市可以郵寄續簽，如江蘇連雲港市）
辦理時限自受理之日起7個工作日。
費用壹次往來簽註每個20元；二次往來簽註每個30元。
特別註意《往來港澳通行證》有效期不足6個月（部分城市是3個月）的或無足夠空白簽註頁的不能辦理，須按首次申請手續辦理新的《往來港澳通行證》，同時申請簽註。
二、代辦：
若是首次申請辦理港澳通行證需要攜帶本人身份證以及照片；若非首次申請，則需帶好本人身份證及前壹次辦理的通行證，如請人代辦還需攜帶代辦人身份證。
三、過期：
《港澳通行證》過期，需要妳本人親自到妳戶口所在地的縣（區）級以上的公安局出入境管理部門辦理換證手續，需要攜帶的資料和相關手續跟第壹次辦理時是壹樣的。
辦理時需要攜帶以下資料：
1、妳的身份證原件及復印件
2、復印件為A4規格（身份證需要復印正反面，戶口簿需要復印戶主頁，和妳所在的那壹頁）
3、二寸正面免冠平面彩色近照，藍色背景，著深色有領上衣，照片大小48X33mm頭部寬度21-24mm頭部長度28-33mm（必須在公安局指定的照相館拍照，也可以在出入境拍照，記得拿照相回執，建議在出入境拍照）
4、舊的港澳通行證，需要交回出入境管理局。
正常情況下，需要10個工作日 （辦理換證，需要經省級部門審批、制證，需要的時間比較長，大概10個工作日，即兩個星期的時間）。
參考資料：
中華人民***和國往來港澳通行證百度百科