具體內容參見“世界貿易中心”
遺址動工
世貿中心倒塌後，重建新大樓與否的爭議不斷，有人認為應該重建以恢復該區的貿易功能，且不向恐怖份子低頭。但也有人認為在死傷慘重之處重建會對受害者不敬。最終決定重建，並國際征圖，在競圖後決定出重建的模型，主體建築定名為自由塔（Freedom Tower）。2006年4月27日，自由塔的修建工程經歷種種曲折後啟動。預定2014年竣工啟用。2005年9月，倒塌地點的地鐵車站先行開始重建。
2006年9月6日，世貿中心參觀者悼念中心的揭幕儀式舉行。在世界貿易中心紀念館竣工前，這裏將作為世貿中心臨時的悼念場。9月7日，負責重建的有關當局公布了東側3座摩天大樓的設計方案。它們將在世貿中心紀念館的周圍組成壹個半圓形，分別為78層、71層和61層。
重建
紐約市議會主席皮特·瓦洛內稱，紐約市政府正在組建壹個委員會，研究重建世貿中心問題。據法新社報道，瓦洛內說：“我們正在準備成立世貿中心重建委員會。”他還說，這個委員會將直接由紐約市長朱利安尼負責，具體重建計劃不知何時能夠出臺。
“按美國人的習慣，原封不變並原地復制世貿中心的可能性不大。”
曾任紐約城市規劃委員、現美國龍安建築規劃設計顧問公司董事、美籍華裔建築師饒及人先生在接受記者采訪時說：
“雙子大樓的消失對紐約來說是極大的損失，近十年建造起來的建築竟在瞬間化為烏有。但就我個人在美國生活工作30余年的體會，美國人喜歡向前看，尤其在城市建設方面，歷史就是歷史，已經過去了，所以原地復制不太可能。但為了保持曼哈頓的輪廓，有壹種可能是在世貿中心原址附近建造高度相同的第二個世貿，而原址保留起來供人們憑吊。雖然曼哈頓用地已很緊張，但還是有空地的，比如炮臺公園附近。”
“即使在原址上重建雙子大廈，也將延續它的精神，不會照搬，很有可能會做壹些改進，以解決原大廈給此地造成的風洞效應。在冬天風大的時候，由於強烈的風洞效應影響，大廈的附近幾乎不能行走，而當年建造時，建築師還不懂得‘風洞實驗’。”
美國人心中的雙子大廈有多重要呢？饒先生做了個比方，它對於美國人尤其是紐約人來說，就像故鄉的大樹，從遠遠的海上或空中看見它，就能找到回家的感覺。
2013年5月2日，世貿重建工程迎來歷史性時刻，世貿中心壹號樓的主體工程竣工，就此成為西半球最高建築物，同時也是世界第三高建築物。
重建後的紐約世貿中心包括6座摩天樓，分別為1到5號樓和早已落成的7號樓。全部工程將於2015年或2016年竣工。
以下是世貿中心重建後的建築：
世界貿易中心壹號大樓（自由塔）、世界貿易中心二號大樓（格林威治街200號）、世界貿易中心三號大樓（格林威治街175號）、世界貿易中心四號大樓（格林威治街150號）、世界貿易中心五號大樓（自由街130號）、世界貿易中心七號大樓以及九壹壹國家紀念博物館交通轉運設施世貿中心站。
計為104層高的摩天大樓“自由塔”(One World Trade Center)2010年8月已悄悄地破土動工。這座大樓由建築師丘德斯(David Childs)設計，建成後將是美國第壹高樓。它的高度將達到1776英尺(541米)，寓意就是美國獨立的年份。這座大樓已經於2014年全部完工，辦公面積達26萬9000平方米，其余4.6萬平方米為商場、餐廳和瞭望臺等設施。
Cushman & Wakefield房產公司的副主席斯達克姆(Tara Stacom)說，建造清真寺引起的爭議對這座大樓沒有造成影響。
她說：“沒什麽影響。”只要“世界貿易中心”受到關註，“需求就會很強勁。”
“這座大樓將給這座城市帶來新的氣息，很多公司都表達了入住的意向。”
報道稱，壹家中國公司成為首個簽署入住協議的公司。該公司將租賃“世界貿易中心”1.7萬平方米的辦公面積，計劃在此設立壹個為中國服務的貿易中心。
2013年11月12日，美國紐約世界貿易中心壹號樓建成。據悉，該大樓為北美地區的最高建築，高度為1776英尺（541.3米），打破了原先由芝加哥西爾斯大廈保持的紀錄。
重新開放
據網易等媒體報道“9.11”恐怖襲擊發生13年之後，美國紐約的新世界貿易中心於2014年11月3日正式開門營業。耗資38億美元的新世界貿易中心歷時八年，終於成為目前美國最高的建築。