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復旦中學前身為復旦公學，由我國著名教育家馬於1905創辦。在百年歷程中，復旦公學、復旦附中、復旦附中經歷了三個歷史發展階段。孫中山先生任總校董，嚴復、於右任、邵力子等著名學者和政治家是復旦中學的創始人。
2010在學校的領導下，“復旦基礎教育論壇”發展成為“復旦基礎教育聯盟”。復旦大學在學校文化建設、課程建設、教師隊伍建設、圖書館建設、實驗室建設等方面與復旦中學互聯互通，支持了復旦中學的發展。
學校多次被評為上海市文明單位、上海市教育系統先進集體、上海市教育系統五五期間先進單位、上海市中小學行為規範示範學校、聯合國教科文組織環境人口與可持續發展(EDP)項目實驗學校、上海市科技教育特色示範學校、上海市TI數理教學技術示範學校、上海市德育管理與研究培訓基地主辦學校。上海市“2049(全民科學素養行動計劃)工程”試點學校、上海市關心下壹代工作先進集體、上海市知識產權試點學校等榮譽稱號。學校與數十所國內外名校建立了友好學校，長期開展國內外師生教育交流。