壹、指代不同
1、nt：又叫堿基，，是形成核苷的含氮化合物，核苷又是核苷酸的組分。堿基、核苷和核苷酸等單體構成了核酸的基本構件。
2、bp：又叫堿基對，是壹對相互匹配的堿基（即A—T， G—C，A—U相互作用）被氫鍵連接起來。
二、結構不同
1、nt：具有雙環結構。胞嘧啶、尿嘧啶、胸腺嘧啶屬於嘧啶族（Y），環系是壹個六元雜環。也被稱為主要或標準堿基。它們是組成遺傳密碼的基本單元，其中堿基A、G、C和T存在於DNA中，而A、G、C和U存在於RNA中。
2、bp：是形成DNA、RNA單體以及編碼遺傳信息的化學結構。組成堿基對的堿基包括A、G、T、C、U。嚴格地說，堿基對是壹對相互匹配的堿基(即A：T，G：C，A：U相互作用)被氫鍵連接起來。
三、用處不同
1、nt：通過***價鍵與核糖或脫氧核糖的1位碳原子相連而形成的化合物叫核苷。核苷再與磷酸結合就形成核苷酸，磷酸基接在五碳糖的第5位碳原子上。
2、bp：常被用來衡量DNA和RNA的長度（盡管RNA是單鏈）。與核苷酸互換使用，盡管後者是由壹個五碳糖、磷酸和壹個堿基組成。
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