iPhone6可流暢運行ios8與ios9，目前最高可刷入ios9.0.2。
：iPhone6被判抄襲 蘋果起訴北京知識產權局
2016年6月，北京知識產權局認定蘋果公司iPhone6和iPhone6 Plus外觀設計侵犯深圳佰利公司的專利權，責令蘋果公司停止銷售。蘋果公司和中復公司不服，將北京知識產權局起訴到北京知識產權法院。目前，法院已立案。[17]
2017年3月，中國壹家法庭做出了有利於蘋果的裁決。這壹裁決也推翻了之前禁止蘋果在中國部分地區銷售iPhone 6和iPhone 6 Plus手機的禁令。