根據2016年3月研究所官網顯示，中國農業科學院煙草研究所有在職職工206人，離退休人員141人。在職人員中，專業技術人員168人，45歲以下專業技術人員119人，占專業技術人員總數的71%。正高職稱專家29人，副高職稱專家54人，中級職稱62人。具有博士學位49人，碩士學位66人，碩士以上學歷占在職職工的50%以上。博士、碩士生導師51人，博士後研究人員4人。享受國務院政府特殊津貼17人，農業部有突出貢獻的中青年專家2人，煙草行業學科帶頭人2人，中國農業科學院青年英才計劃入選者2人，國家公益性行業專項首席科學家1人，中國農業科學院科技創新團隊首席科學家6人。
農業部有突出貢獻的中青年專家：王元英、劉洪祥
國家公益性行業專項首席科學家：王元英
煙草行業學科帶頭人：王元英、劉洪祥
中國農業科學院科技創新團隊首席科學家：王樹聲、王元英、郭永峰、孔凡玉、張忠鋒、王鳳龍
中國農業科學院青年英才計劃入選者：孔英珍等
高級專家： 高級專家 類別姓名正高級專家 王元英、王樹聲、王鳳龍、梁洪波、王誌德、孫福山、劉好寶、管輝、王允白、李毅君、孫玉合、石屹、徐宜民、張忠鋒、馮全福、錢玉梅、時焦、孔凡玉、申國明、劉貫山、郭承芳、陳剛、羅成剛、郭永峰、徐秀紅、孔英珍、杜詠梅 副高級專家 丁昌敏、孫希芳、張懷寶、徐秋萍、商耀、劉新民、劉偉、章啟發、張連、張文麗、付憲奎、戴培剛、任廣偉、許立峰、竇玉青、邱軍、陳誌強、梁曉芳、李義強、冀永清、張久權、吳潔、陳德鑫、楊愛國、董建新、劉艷華、常愛霞、王傳義、王靜、張成省、王紹美、任民、王衛鋒、馬興華、申莉莉、劉少雲、龔達平、李鳳霞、陳愛國、孫惠青、王新偉、楊金廣、遲立鵬、宋誌美、王倩、張繼光、王秀芳、王秀國、曹鵬雲 資料來源： 根據2016年3月研究所官網顯示，中國農業科學院煙草研究所設有8個科研部門，有農業部重點實驗室2個，煙草行業重點實驗室2個，中國農業科學院重點開放實驗室1個，中國農業科學重點科技創新團隊2個，6支所級科研創新團隊。
農業部重點實驗室：農業部煙草生物學與加工重點實驗室、農業部煙草質量安全風險評估實驗室
煙草行業重點實驗室：煙草行業煙草基因資源利用重點實驗室、煙草行業煙草病蟲害監測與綜合治理重點實驗室
中國農業科學院重點開放實驗室：中國農業科學院煙草遺傳改良與生物技術重點開放實驗室
中國農業科學重點科技創新團隊： 名稱負責人煙草遺傳育種創新團隊王元英煙草栽培營養與調制加工創新團隊王樹聲資料來源： 所級科研團隊：煙草遺傳育種科研團隊、煙草功能基因組科研團隊、煙草栽培與調制科研團隊、煙草質量安全風險評估科研團隊、煙草功能成分與綜合利用研究科研團隊、煙草病蟲害防控科研團隊 館藏資源 根據2016年3月研究所官網顯示，中國農業科學院煙草研究所館藏圖書、資料、期刊***60000余冊（部），保存煙草種質資源5300多份，獨家保存量居世界首位。 儀器設備 根據2016年3月研究所官網顯示，中國農業科學院煙草研究所專用科研儀器設備1300余臺（套）。 有科研、實驗用房（樓）等總建築面積40000余平方米，專用科研儀器設備1300余臺（套），試驗用地73.6公頃。其中，青州試驗基地27.6公頃，青島試驗基地31.4公頃，西昌試驗基地14.6公頃。
截至2015年12月，農業部煙草生物學與加工重點實驗室儀器設備總值1320萬元，其中10萬元以上大型儀器設備總值1044萬元。 農業部煙草質量安全風險評估實驗室（青島）配備有氣質聯用儀、液質聯用儀、電感耦合等離子質譜儀等儀器設備100余臺（套）。 煙草行業煙草基因資源利用重點實驗室有遺傳分析儀、熒光定量PCR儀、高速離心機、生物倒置顯微鏡等儀器設備，價值1448.5萬元，其中10萬元以上設備40余臺（套），價值1250萬元。 煙草行業煙草病蟲害監測與綜合治理重點實驗室有全溫震蕩培養箱、自動進樣儀等儀器6臺套，價值20萬元。 國家煙草改良中心有液質聯用儀、ICP-MS、基因分析儀、蛋白質雙向電泳儀、生物信息學分析平臺、人工氣候室、超速離心機、超低溫冰箱、細胞 融合儀、紫外分光光度計、酶標儀、熒光定量PCR儀、凝膠掃描儀、遺傳分析系統、生物顯微鏡、倒置生物顯微鏡、高效生物層析系統等儀器設備400余臺 （套），價值3000余萬元。