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平潭綜合實驗區管理委員會(簡稱平潭綜合實驗區管委會)是福建省平潭綜合實驗區的行政管理機關，是福建省人民政府的派出機關，與中國***產黨福建省委員會的派出機構中國***產黨福建省平潭綜合實驗區工作委員會(簡稱平潭綜合實驗區黨工委)合署辦公，實行"兩塊牌子，壹套人馬"的體制。
?2009年7月，福州(平潭)綜合實驗區管理委員會成立，2010年2月更名為福建省平潭綜合實驗區管理委員會，行政級別升格為正廳級。區黨工委、管委會駐地位於福州市平潭縣潭城鎮。