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gtex數據怎樣篩選

關於gtex數據怎樣篩選。

1、通常我們在挖掘TCGA數據庫的時候,會發現該項目納入的正常組織測序結果是非常少的,也就是說很多病人都不會有他的正常組織的轉錄組測序結果,比如說乳腺癌吧,1200個左右的轉錄組數據,其中1100左右都是腫瘤組織的測序數據,只有區區100個左右的正常對照。

2、這個時候我們就需要想辦法加大正常組織測序樣本量,既然TCGA數據庫沒有,我們就從其他數據庫著手。這裏值得大力推薦的是GTEx數據庫,Genotype-TissueExpression(GTEx)。