經國家煙草專賣局批準，雲南煙草科學研究院（以下簡稱雲南院）成立於1998年，現隸屬於雲南中煙工業公司。雲南院是專門從事基礎性、前瞻性、***性技術研究的綜合科研機構，位於昆明國家高新技術產業開發區，占地面積7萬平方米，建築面積5萬平方米，固定資產原值3.7億元。
雲南院以“服務決策、服務企業、服務品牌”為宗旨，致力於煙草科學發展、科技創新。按照《煙草行業中長期科技發展規劃綱要》的總體要求，依靠科技創新，以“卷煙上水平”為發展目標，實施專項科技攻關，積極開展煙草化學、卷煙減害降焦、煙草添加劑檢測、特色煙用香原料與增香保潤、卷煙原料及薄片、煙草經濟信息等領域的研究、開發及應用。
雲南院立足雲南，面向全國煙草行業。擁有先進的煙草化學和生物學分析測試平臺、減害降焦技術創新平臺、特色香原料研發與種植基地、卷煙原料工業應用實驗室、煙草決策科學研究平臺等重要的產學研合作科技創新支撐條件，擁有煙草化學省級重點實驗室和省級創新團隊。企業博士後科研工作站已獲得人力資源和社會保障部及全國博士後管理委員會批準。
雲南院在崗職工119人，其中博士18人、碩士34人，高級技術職稱31人，高中級職稱人員占總人數的65.7％，有1人享受國務院政府特殊津貼、3人享受雲南省人民政府特殊津貼，擁有雲南省有突出貢獻的優秀專業技術人才1人，雲南省中青年學術和技術帶頭人3人、雲南省技術創新人才7人。
建院以來先後承擔國家級、省部級、地廳級科研項目260余項，獲得各級科技進步獎60余項，授權專利27項，出版專著（論文集）45部，發表論文904篇。