第壹屆
所 長: 黃心川 (1988——1994年)
副所長: 邵心潔 (1988——1995年)
史 敏 (1988——1994年)
趙階琦 (1991——1994年)
王運久 (1992——1994年)
書 記: 邵心潔 臨時機關黨委書記 (1989——1992年)
王運久 黨委書記 (1992——1994年)
第二屆
所 長: 張蘊嶺 (1994——2007年)
副所長: 孫景超 (1994——1996年)
孫士海 (1994——2010年)
葛良誌 (1996——1997年)
孫叔林 (1997——2001年)
韓 鋒 (2001——今)
張宇燕 (2003——2007年)
書 記: 孫景超 亞太、日本所聯合黨委書記 (1994——1996年)
葛良誌 黨委書記 (1996——1997年)
孫叔林 黨委書記 (1997——2001年)
張蘊嶺 黨委書記 (2001——2003年)
張宇燕 黨委書記 (2003——2009年)
第三屆
所 長: 張宇燕 (2007——2009年)
副所長: 孫士海 (1994——2010年)
韓 鋒 (2001——今)
書 記: 張宇燕 黨委書記 (2003——2009年)
第四屆
所 長: 李向陽 (2009——今)
副所長: 孫士海 (1994——2010年)
韓 鋒 (2001——今)
李 文 (2010——今)
書 記: 李向陽 黨委書記(2009——今)