首先查看所得稅申報表基本信息表。
1.檢查申請確認表中的員工人數是否與基本信息表中的人數壹致。職工人數明顯不壹致，影響科技人員比例的，直接作為“科技人員比例不符合要求”否決。
2.檢查R&D項目立項和驗收情況，對比R&D費用集中的R&D人員數量與直接人工工資總額，檢查工資總額超過正常水平的企業代扣代繳個人所得稅情況，沒有代扣代繳個人所得稅的以“R&D費用歸集不準確(不真實)”駁回。
二、查看高新技術企業優惠名單
重新申請高新技術企業認定，應重點關註納稅人上壹年度享受高新技術企業優惠待遇的名單。如果企業申請認定信息與優惠名單中職工人數、科研人員人數等數據不壹致，材料因不符合要求將被直接拒絕。
第三，檢查企業的財務報表
1.檢查財務報表之間的勾對關系，看年度前後的數據結轉是否壹致。特別是上年度資產、負債、所有者權益數據前後數據是否銜接，不壹致的，按不規範財務核算處理。
2.看企業的成長性。如果收入和凈資產的增長為負，直接“R&D成果的增長和轉化都很弱”就會被否決。
第四，查看企業的其他申請材料。
1，看報名時間。看企業是否成立1年，不足1年，直接否決；
2、查詢企業所得稅申報表，原申報中是否有核定征收，直接否決核定征收企業和現轉為查賬征收但查賬征收不滿三個納稅年度的原核定征收企業。
3.查看出具審計鑒定材料的中介機構是否符合要求，是否成立三年。全年月均人數是否達到20人，註冊會計師或稅務師比例是否達到30%。不符合條件的，按中介不匹配，予以拒絕。