《十二猴子》電影深度解析是：
1、在未來的2035年，作為囚犯的詹姆斯·科本奉科學家之命乘坐時光機返回到1996年尋找壹種病毒的起源。原來，在1996年的時候，世界被壹種致命的病毒感染，有五十億人死亡，剩下的人不得不躲入地下，科學家們想到找出它的源頭，並阻止擴散。?
由於出現誤差，詹姆斯被送到1990年的巴爾的摩，並被當做精神分裂癥患者關進精神病院。凱瑟琳是醫院的主治醫生，她和其他醫生同意詹姆斯給科學家打電話，但是接電話的是壹個家庭主婦。所有人都相信詹姆斯只不過是壹個精神病患者，他說的病毒毀滅人類是無稽之談。
2、傑弗裏是精神病醫院的壹名病人，他堅持為動物的權益戰鬥，是壹個不折不扣的瘋狂的人。傑弗裏帶著詹姆斯進行了壹場“豪華之旅”，壹直介紹自己的見解，認為瘋狂的不是自己，而是外面的那些人。他知道詹姆斯壹直想逃出去，就故意鬧出動靜，吸引警衛的註意，讓詹姆斯有機會逃出去。不過，由於被註射了安定劑，詹姆斯沒逃出多遠就被抓回來了，還被單獨關進房間。
3、正當醫生們爭論的時候，詹姆斯消失了，所有人都覺得莫名其妙。原來科學家把他傳送回來了，並看到傑弗裏的照片，才知道他是“十二猴子軍團”的壹員。
科學家們壹直認為病毒的起源和“十二猴子軍團”有密切的關系，就再次安排詹姆斯返回到過去，但是這次穿越仍然出現失誤，被傳送到壹戰的戰場上，還受了傷。終於，詹姆斯被傳送到1996年的巴爾的摩，見到了凱瑟琳，讓她開車送自己到費城——病毒的起源地。壹路上，詹姆斯對這個世界充滿好奇，這也讓凱瑟琳感到意外。
4、在費城，詹姆斯和凱瑟琳發現“十二猴子軍團”的塗鴉，並找到其總部所在地。原來這個組織的負責人是傑弗裏，他從精神病院出來後創立了“十二猴子軍團”，聚集壹幫人維護動物權益，而他的父親則是著名的病毒學家。
詹姆斯和凱瑟琳感到傑弗裏家中，見到這個瘋狂的家夥，勸說他不要透出父親的病毒，結果被趕出來了。凱瑟琳本想勸詹姆斯自首，卻發現他突然消失了，只好和警察離開。
5、詹姆斯再次返回到2035年，面對科學家們言不由衷的恭喜，他覺得這壹切都不是真的，自己真的瘋了。詹姆斯再次要求返回1996年的費城，他表面上是為了拯救人類，其實是為了凱瑟琳，想和她***度余生。
與此同時，凱瑟琳發現詹姆斯的話壹壹應驗，開始相信這個人是從未來穿越而來，打電話警告傑弗裏的父親，但是被對方無視了。凱瑟琳終於又看到了詹姆斯，請他幫助自己組織傑費裏的行動，但是詹姆斯說自己瘋了，之前的壹切都是假的。
6、凱瑟琳按照詹姆斯所說的號碼打過去，對方只是壹家地毯清潔公司，根本沒有什麽科學家，這讓凱瑟琳非常開心，覺得世界安然無恙。詹姆斯卻說科學家已經收到了這個電話，還說自己聽到了電話錄音。；兩人決定不再理會是是非非，準備壹起到佛羅裏達去看海，經過壹番喬裝打，他們躲過警察的搜捕，來到了機場。傑弗裏帶著壹幫人打開動物園的大門，將所有的動物都釋放出來。