公司自成立以來在通用航空領域創造了多項全國第壹，已成為中國通用航空領域的壹支重要力量。1988年，公司在競標中戰勝多家外國公司，獲得新疆吐魯番盆地的航空物探任務，征服了號稱“死亡之海”的新疆塔克拉瑪幹大沙漠，探明了該地的地質構造，為新疆今天的石油開發打下了基礎。1987年以來，公司先後托管國家海洋局的三架海監飛機，執行我國的海洋執法、海洋維權和海洋災害監測等任務，為維護國家海洋權益做出重要貢獻。1999年，公司首次派出二架直升機隨中國極地科學考察隊乘“雪龍號”科學考察船前往南極進行科學考察，是中國第壹個進入極地飛行的航空公司，並由此載入“中國企業新紀錄”。至今已先後九次派直升機赴南極、北極進行科學考察。
2005年9月26日，公司在尼泊爾投資組建的“尼泊爾飛龍航空有限公司”正式投入客貨運營，成為中國成功在國外投資組建航空公司的第壹家。
2006年2月21日，中國飛龍通用航空有限公司首家通過中國民航CCAR-135部《小型航空器商業運輸運營人運行合格審定規則》的運行合格審定，榮獲運行合格證，標誌著飛龍公司成為中國首家進入支線航空運輸市場的商業運輸運營人。2006年5月29日，公司又通過了中國民航CCAR-91部《壹般運行和飛行規則》的運行合格審定。我公司航修廠是取得中國民航CCAR-145部維修許可證和中國人民解放軍陸航部維修許可證的維修單位，多年來為本公司、其它航空公司和部隊大修飛機、直升機近百架。
多年來，飛龍公司始終堅持“安全第壹，預防為主”的方針，把飛行安全作為公司的立業這本。公司於1999年首次獲得民用航空局頒發的通用航空安全最高獎“金鷗杯”，是地方航空公司獲此殊榮的第壹家。2004、2005年又兩次蟬聯“金鷗杯”。