乙型肝炎e 抗原（HBeAg），壹般通稱e 抗原。它來源於乙型肝炎病毒的核心，是核心抗原的亞成分，或是核心抗原裂解後的產物。
e 抗原是可溶性蛋白。當核心抗原裂解時，可溶性蛋白部分（即e 抗原）
溶於血清中，存在於血液循環中，若取血化驗就可查出來。核心抗原在患者血清中查不到，僅在肝細胞中才能查到。故查出e 抗原，其意義就等於查出核心抗原，表示病毒復制活躍，並且傳染性較強。壹般HBsAg（+）的人，用比較敏感的固相放射免疫法檢查e 抗原，可有61% 的人HBsAg（+）。而如果HBsAg（+），其意義與在血中存在病毒顆粒，或在血中查出乙型肝炎病毒DNA 或核心抗體IgM 相同。
e 抗體是乙型肝炎e 抗體的簡稱（抗-HBe），它是由e 抗原刺激人體免疫系統產生出來的特異性抗體，這種特異的e 抗體能夠和e 抗原結合。當乙型肝病患者由HBsAg（+）轉變成抗-HBe（+），叫作血清轉換。抗-HBe（+）時，乙肝病毒在肝組織內的復制逐漸減少，由病毒復制活躍期轉變成不活躍期，肝組織的炎癥也常由活動變成不活動，血中及肝組織內病毒顆粒均減少，因此傳染性也減少。但抗-HBe 和抗-HBs 不同，e 抗體不是保護性抗體，不代表患者有了免疫力。有時雖然檢查出e 抗體陽性，但肝細胞內仍然可以查出乙型肝炎病毒DNA，表明病毒仍然存在。大量研究資料表明，e 抗體出現陽性是病毒復制降低並且傳染減少的標誌，這時病毒顆粒有可能已經很少，但並不表示病毒已被消除了。