1999 年初經教育部批準設立的國家級基地， 2003 年 4 月已被教育部正式授牌。基地建設以來，開展了多種多樣的文化素質教育活動。如，每年對新生進行語文水平測試、每年舉辦“文治杯”大學生文學藝術作品大獎賽、面向全校學生舉辦經常性的文化素質教育講座、向學生推薦 100 本人文閱讀書目、組織編寫《大學生文化素質教育叢書》*** 14 本； 2001 年 12 月“加強校園文化建設，提高學生文化素質”項目獲上海市教學成果壹等獎， 2002 年 5 月又獲國家級教學成果二等獎； 1999 年 8 月、 2002 年 8 月主持了兩次華東地區高校文化素質教育研討會， 2002 年 5 月主辦全國大學語文第九屆學術年會，發揮了基地的輻射作用。
基地主任由夏中義教授擔任 人文學院思想政治理論教育中心以原上海交通大學“兩課”教育中心為基礎於2005年6月正式成立。“中心”負責上海交大從本科生到研究生的思想政治理論課教學、科研及相關學科建設工作。“中心”下設四個課程組和壹個研究所，即“馬克思主義基本原理”課程組、“毛澤東思想、鄧小平理論和‘三個代表’重要思想概論”課程組、“中國近現代史綱要”課程組和“思想道德修養與法律基礎”課程組以及思想政治理論教育研究所。現有教師40余名，其中教授12人，副教授21人，講師8人；具有博士學位的教師11人，具有碩士學位的教師20人。
人文學院黨總支書記、副院長黃偉力教授任“中心”主任，胡果文、胡涵錦教授任“中心”副主任。 藝術教育中心現有教師12名，教授1人、副教授1人、講師10人，主要從事藝術鑒賞必修課和選修課以及校學生藝術團建設。 1995 年，該校被教育部體衛藝術教司列為“在普通高校中開展藝術教育的上海地區試點”； 1999 年，該校又被列為普通高校的 32 個“大學生文化素質教育基地”之壹，藝教中心則是基地的重要組成部分。近 5 年來，取得了令人矚目的成績。藝教中心教師自編自錄的教材和 CD 獲得了學校的教材優秀獎和教學成果獎；而校學生藝術團（包括學生交響樂團、管樂團、合唱團、民樂團、舞蹈隊、話劇隊和電聲樂隊等）不僅為校園文化建設作出了貢獻，而且在上海市和全國乃至國際音樂節比賽中爭金奪銀，為祖國爭得了榮譽。
中心主任由上海交通大學黨委副書記潘敏擔任。